商家居住在店铺是否违法，需根据具体情况综合判断，不能一概而论。以下是从不同角度进行的分析：
消防安全角度：
- 合法情况：如果商铺经过了合法的消防改造，并通过了消防验收，达到了居住的消防安全标准（如设置了火灾自动报警系统、自动喷水灭火系统、消防疏散通道等），且居住部分与商业经营部分进行了有效的防火分隔，那么在此情况下商家居住在店铺是允许的，不违法。例如，某些商业综合体中的店铺，在规划和设计时已考虑了居住功能，并配备了相应的消防设施。
- 违法情况：若商铺未进行消防改造或不符合消防居住条件却擅自住人，这是极其危险且违法的行为。此类行为违反了《中华人民共和国消防法》等相关法律法规，可能面临消防部门的行政处罚，包括责令改正、罚款等。若因此引发火灾等严重后果，还可能承担刑事责任。小型商铺尤其需要注意，若无任何消防分隔和消防设施，店主直接在店内居住，将严重威胁人员安全，此类情况严重违反消防规定。
房屋性质和规划用途角度：
- 合法情况：部分商铺在规划设计时即被明确允许具有居住功能，如商住两用性质的商铺。这类商铺的土地性质和规划用途中包含居住部分，因此商家居住在店铺是合法合规的。
- 违法情况：若商铺的规划用途仅为商业经营，不允许居住，则商家居住在店铺属于改变房屋使用性质的行为，违反了相关的规划管理规定。房地产管理部门等相关机构有权责令改正，并可能给予相应处罚。
地方法律法规角度：
- 不同地区对于商家居住在店铺的规定可能存在差异。有的地方可能明确禁止商家居住在店铺，而有的地方则可能无此类明确规定。因此，在判断商家居住在店铺是否违法时，必须参考当地的相关法律法规。例如，某些地区可能出于安全、卫生或城市规划等方面的考虑，对商家居住在店铺进行了限制或禁止。
合法改造与审批角度：
- 即使商铺原本不具备居住功能，但若经过了合法的改造和审批程序，满足了居住的条件，并且符合了相关的建筑、消防等规定，那么商家也有可能可以居住在店铺。但这需要确保所有的改造和审批手续都是合法有效的，否则仍可能面临法律风险。
建议与指导：
- 在决定是否在店铺中居住之前，建议商家先了解当地的相关法规和规定，确认店铺是否可以住人以及需要满足哪些具体条件。
- 如果商家打算在店铺中居住，最好先咨询相关部门或我的意见（我是范玲玲律师，专注于刑事辩护、经济纠纷、婚姻家庭、合同纠纷、房产纠纷、涉外纠纷、离婚财产纠纷领域），以确保行为合法合规，避免不必要的法律风险和经济损失。
综上所述，商家居住在店铺是否违法取决于多种因素，包括消防安全、房屋性质与规划用途、地方法律法规以及合法改造与审批等。因此，在做出决定之前，务必进行充分的了解和咨询，以确保自身行为的合法性。