当工程质量检查不合格时，处理方式需根据具体情况和法律规定来综合判断，以下是详细的处理思路：
明确不合格原因与责任主体
- 首先需通过专业鉴定或检测，确定工程质量不合格的具体原因，如设计缺陷、施工不当、材料不合格等。
- 根据原因确定责任主体，可能是建设单位、施工单位、设计单位或监理单位等。例如，若因施工单位未按规范施工导致质量不合格，则施工单位应承担主要责任。
依据合同与法律规定处理
- 合同约定：检查施工合同中关于工程质量、验收标准、违约责任等条款。若合同中有明确约定，如质量不合格的整改期限、违约金等，应按合同约定执行。
- 法律规定：根据《中华人民共和国建筑法》、《建设工程质量管理条例》等相关法律法规，工程质量不合格可能涉及行政处罚（如罚款、责令整改、停业整顿等）和民事责任（如赔偿损失、修复工程等）。
具体处理措施
- 整改与修复：责任主体应按照要求进行整改或修复，直至工程质量符合标准。整改期间可能需暂停施工，避免问题扩大。
- 赔偿损失：若工程质量不合格导致他人财产或人身损害，责任主体需承担赔偿责任。赔偿范围包括直接损失和间接损失，如修复费用、停工损失、第三方索赔等。
- 行政处罚：建设行政主管部门可对责任主体进行行政处罚，如罚款、吊销资质证书等。处罚力度根据违法情节严重程度确定。
- 信用惩戒：在建筑市场信用评价体系中，工程质量不合格可能影响责任主体的信用评级，进而影响其未来参与工程项目的机会。
争议解决途径
- 协商：各方可尝试通过协商解决争议，达成整改或赔偿协议。
- 调解：可申请第三方调解机构介入，协助各方达成和解。
- 仲裁或诉讼：若协商、调解无果，可依据合同中的仲裁条款或事后达成的仲裁协议申请仲裁，或直接向法院提起诉讼。
预防措施
- 加强过程管理：建设单位、施工单位等应加强工程质量管理，确保施工符合规范，材料合格。
- 完善合同条款：在签订合同时，明确工程质量标准、验收程序、违约责任等，减少争议发生。
- 定期检查与评估：定期对工程质量进行检查与评估，及时发现并解决问题。
总结：工程质量检查不合格时，应首先明确原因与责任主体，然后依据合同与法律规定采取整改、赔偿、行政处罚等措施。若发生争议，可通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决。同时，各方应加强过程管理，完善合同条款，定期检查评估，以预防类似问题再次发生。如有具体法律问题，欢迎直接向我咨询。