在双方存在转包合同关系的情况下，基于合同相对性向其主张工程款的依据主要来源于合同法的相关规定以及合同相对性原则的应用。以下是对这一问题的详细分析：

1. 合同相对性原则：

   • 合同相对性原则是指合同主要在特定的合同当事人之间发生法律约束力，只有合同当事人一方能基于合同向对方提出请求或提起诉讼，而不能向与其无合同关系的第三人提出合同上的请求，也不能擅自为第三人设定合同上的义务。
   • 在转包合同关系中，转包人与承包人之间签订了转包合同，双方形成了合同关系。因此，承包人（或实际施工人，在符合一定条件下）有权基于这份转包合同向转包人主张工程款。

2. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。
   • 在建设工程领域，虽然直接的法律条文可能并未明确提及转包合同中的工程款主张问题，但合同相对性原则作为合同法的基本原则，同样适用于建设工程合同及其转包合同。
   • 此外，如果转包行为违反了法律法规的强制性规定（如未经发包人同意的转包），则转包合同可能被认定为无效。但在合同无效的情况下，如果建设工程经竣工验收合格，承包人仍有权请求参照合同约定折价补偿，这实际上也是基于合同相对性原则的一种变通处理。

3. 实际施工人的特殊情况：

   • 在建设工程领域，实际施工人（即实际完成工程建设但未与发包人签订建设工程施工合同的主体）在特定条件下也有权向转包人主张工程款。
   • 根据相关司法解释和实务操作，实际施工人可以突破合同相对性原则，直接向发包人主张工程款（在发包人欠付转包人工程价款范围内）。但这一规定并不排除实际施工人基于转包合同向转包人主张工程款的权利。

4. 主张工程款的注意事项：

   • 承包人或实际施工人在主张工程款时，应确保转包合同的有效性（或至少证明自己已实际履行了合同义务且工程已验收合格）。
   • 应收集并整理好相关证据材料，如转包合同、工程验收报告、结算单据等，以证明自己的主张。
   • 在主张工程款的过程中，应注意诉讼时效的问题，避免因超过诉讼时效而丧失胜诉权。

建议：如果您在转包合同关系中遇到工程款主张的问题，建议首先审查转包合同的效力及履行情况，然后收集相关证据材料，并考虑咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。