事业单位在特定情况下是会签订三方协议的，但并非所有情况都会涉及。以下是对这一问题的详细解析：
一、会签订三方协议的情况
招聘应届毕业生：
- 三方协议，即《全国普通高等学校毕业生就业协议书》，是明确毕业生、用人单位和学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面表现形式。对于事业单位招聘应届毕业生而言，签订三方协议是常见的做法。这有助于事业单位锁定所需的毕业生，确保人员招聘计划的顺利完成；同时，也为毕业生提供了就业保障，明确了接收单位、户口和档案的接收等关键事项。
- 具体操作：事业单位在招聘应届毕业生时，会与毕业生和学校共同签订三方协议。协议中会明确毕业生的就业岗位、薪酬待遇、福利待遇等关键条款，以及事业单位和学校的权利和义务。
特定合作、交流或项目：
- 在某些特定的合作、交流或项目中，如果涉及三方权利义务关系需要明确约定，且符合事业单位的规章制度和相关管理要求，事业单位也可能签订三方协议。例如，事业单位与高校、科研机构合作开展科研项目时，可能会签订三方协议来明确各方的责任、权益和利益分配等。
二、不会签订三方协议的情况
非应届毕业生入职：
- 对于已经毕业的社会人员应聘进入事业单位的情况，由于不涉及应届毕业生就业派遣等问题，因此通常不需要签订三方协议。这类人员通常直接与事业单位签订劳动合同，明确双方的权利和义务。
特殊招聘方式：
- 部分事业单位通过特殊的人才引进计划、公开选拔等方式招聘人员，尤其是对于高层次人才或有特殊要求的人员，可能会根据具体的招聘政策和流程，简化或不采用三方协议的方式。而是直接签订更为正式的聘用合同或服务协议，以明确双方的权利和义务。
三、签订三方协议时的注意事项
协议内容的一致性：
- 确保协议中的用人单位名称与单位的有效印鉴名称一致，专业名称与学校教务处的专业名称一致，以避免因名称不一致而导致的协议无效或误解。
违约金条款：
- 如果协议中约定了违约金条款，违约方需承担相应的违约责任，包括支付违约金。因此，在签订协议前，应仔细审查违约金条款，确保其合理性和合法性。
福利待遇的明确：
- 利用协议中的“备注”部分另行约定各自的权利义务，如休假、住房、保险等福利待遇。这有助于防止用人单位承诺与实际不符的情况发生，保障毕业生的合法权益。
签订步骤的规范性：
- 严格按照规定的步骤签订协议，先由用人单位填写完毕并盖章，再到学校就业指导中心签证盖章。这有助于确保协议的合法性和有效性。
四、三方协议与劳动合同的关系
- 三方协议在毕业生到单位报到并签订劳动合同或形成事实劳动关系后，其效力通常被劳动合同所取代。因此，事业单位在与劳动者建立劳动关系时，还需依照《中华人民共和国劳动合同法》的规定订立正式的劳动合同，以明确双方的劳动关系和权益。
总结：事业单位在签订三方协议时，应根据具体情况和需求来确定是否签订。在招聘应届毕业生或涉及特定合作、交流或项目时，可能会签订三方协议；而在招聘非应届毕业生或采用特殊招聘方式时，则可能不签订三方协议。无论是否签订三方协议，事业单位都应确保协议的合法性和有效性，并遵守相关法律法规的规定。同时，也应对协议内容进行仔细审查，确保其内容一致、条款明确、步骤规范，以保障各方的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。