结论：拘役三个月缓刑六个月确实会留下案底。不过，如果是未成年人犯罪且符合特定条件，其案底在一定条件下可以被封存并严格保密。
详细分析：
案底的定义与性质：
- 案底，通常指的是某人过去犯法或犯罪行为的记录，在我国法律体系中，它特指有过刑事犯罪前科的档案记录。这些记录一般由公安部门保存，并作为对犯罪嫌疑人、被告人进行定罪量刑时的参考依据。
拘役与缓刑的法律含义及后果：
- 拘役是刑事处罚的一种形式，意味着被法院判定有罪并受到相应的刑罚。被判处拘役的犯罪分子，由公安机关就近执行，执行期间可以回家，但需遵守相关规定。
- 缓刑则是一种特殊的刑罚执行方式，即在一定的考验期内，如果犯罪分子遵守相关规定，原判的刑罚将不再执行。但缓刑的适用并不改变其犯罪事实和罪名的存在，也不意味着没有犯罪记录。
- 一旦被判处拘役并宣告缓刑，该判决结果会被记录在个人档案中，形成案底。这一犯罪记录将对个人的未来产生诸多潜在影响，特别是在入伍、报考军警院校、就业（特别是某些特定职业如公务员、安保、金融等岗位）时，可能会因犯罪记录而受到限制或歧视。
未成年人犯罪记录的特殊处理：
- 对于未成年人犯罪，我国法律提供了特殊的保护制度。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，犯罪时不满十八周岁且被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。
- 这种封存并非消除犯罪记录，而是对其进行严格保密，除司法机关为办案需要或有关单位根据国家规定进行查询外，不得向任何单位和个人提供。因此，如果未成年人被判处拘役三个月缓刑六个月，其案底在一定条件下可以被封存并严格保密，以减少对未成年人未来学习、生活和工作的不利影响。
法律建议：
- 对于已经留下案底的成年人，应正视自己的过去，积极改正错误，努力融入社会。在就业、教育等方面遇到限制时，可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权益和可能的救济途径。
- 对于未成年人及其家长，应加强对未成年人的法律教育和监管，预防未成年人犯罪。如果未成年人已经犯罪并留下案底，应了解并利用法律提供的特殊保护制度，如犯罪记录封存等，以减少对未成年人未来的不利影响。
法律依据：
- 《中华人民共和国刑法》第七十六条：对宣告缓刑的犯罪分子，在缓刑考验期限内，依法实行社区矫正，如果没有本法第七十七条规定的情形，缓刑考验期满，原判的刑罚就不再执行，并公开予以宣告。
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百八十六条：犯罪的时候不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。犯罪记录被封存的，不得向任何单位和个人提供，但司法机关为办案需要或者有关单位根据国家规定进行查询的除外。依法进行查询的单位，应当对被封存的犯罪记录的情况予以保密。
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