结论：分公司欠款是否可以起诉另一个分公司，需根据具体情况判断，若两个分公司之间存在明确的债权债务关系，且符合法律规定的诉讼主体资格，则可以起诉；若不存在直接的债权债务关系或诉讼主体不适格，则不能直接起诉。以下从不同角度详细分析：
一、法律主体关系与诉讼主体资格
分公司的法律地位：
- 分公司是总公司的分支机构，根据《中华人民共和国公司法》第十四条的规定，分公司不具有法人资格，其民事责任由总公司承担。但这并不意味着分公司不能作为诉讼主体，若分公司依法设立并领取了营业执照，则可直接作为民事诉讼的当事人。
诉讼主体资格：
- 若两个分公司之间存在明确的债权债务关系，且欠款分公司具备诉讼主体资格（即领取了营业执照），则债权人（在此情境下可理解为被欠款的分公司或相关权利人）可以欠款分公司为被告提起诉讼。
- 若欠款分公司未领取营业执照，或两个分公司之间不存在直接的债权债务关系，而是与总公司存在关联，则通常不能直接起诉欠款分公司，而应以总公司为被告或根据具体情况确定诉讼主体。
二、债务承担与财产执行
债务承担原则：
- 分公司之间的债务承担应遵循合同相对性原则，即谁欠款谁偿还。若欠款分公司具备独立的财产和偿债能力，则应由其自行承担债务。
- 若欠款分公司无法偿还债务，且其财产归属于总公司，则债权人可以申请法院执行总公司的财产（包括在总公司财产不足的情况下的其他分公司财产，但需注意这并不意味着可以直接起诉其他分公司来偿还债务）。
财产执行情况：
- 在诉讼过程中，若法院判决欠款分公司承担债务，而其无法履行判决，债权人可以申请法院强制执行欠款分公司的财产。
- 若欠款分公司的财产不足以偿还债务，且其财产实质上归属于总公司，债权人可以申请法院执行总公司的财产。但这需要债权人提供充分的证据证明欠款分公司的财产归属于总公司，且需遵循法律规定的执行程序。
三、实际操作建议
确认债权债务关系：
- 在起诉前，务必确认两个分公司之间是否存在明确的债权债务关系，以及欠款分公司是否具备诉讼主体资格。
全面收集证据：
- 收集与债权债务关系相关的证据，如合同、协议、交易单据、沟通记录等，以证明欠款事实及金额。
- 收集欠款分公司的营业执照、工商登记信息等，以确认其身份和经营范围。
撰写并提交起诉状：
- 起诉状应详细、准确地包含原告与被告信息、诉讼请求、事实与理由、证据清单等内容。
- 向具有管辖权的人民法院提交起诉状及相关证据材料。因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地（欠款分公司主要办事机构所在地）或合同履行地人民法院管辖。
参与诉讼流程并关注执行：
- 遵守法庭纪律，如实陈述，出示证据，进行辩论。
- 根据审理结果，法院作出判决。若欠款分公司未按判决履行，债权人可以申请强制执行。在执行过程中，关注欠款分公司的财产状况及执行进展。
示例说明：
假设A分公司与B分公司之间存在货物买卖合同关系，A分公司已按约交付货物，但B分公司未支付货款。在此情况下，A分公司可以B分公司为被告提起诉讼，要求其支付货款及利息。若B分公司具备诉讼主体资格（即领取了营业执照），且法院判决其承担债务而其未履行判决，A分公司可以申请法院强制执行B分公司的财产。
特殊情况说明：
若两个分公司之间不存在直接的债权债务关系，而是与总公司存在关联（如B分公司是A分公司与总公司之间的交易中介），则A分公司通常不能直接起诉B分公司来偿还债务。在此情况下，A分公司应根据具体情况确定诉讼主体（如总公司或相关责任方）并提起诉讼。
最后建议：在处理分公司之间的债务纠纷时，务必遵循法律程序，全面准备证据和材料。若遇到复杂情况或不确定如何处理时，可以直接向我咨询以获得专业的法律建议和指导。