结论：物业是否合法阻止小区住宅楼一楼诊所挂牌匾，需结合具体情况判断，主要看诊所挂牌匾是否违反了相关法律法规、小区管理规约或物业服务合同的约定。以下从不同角度进行分析：
一、法律法规层面
诊所审批与经营许可：
- 诊所已经获得了相关审批手续，说明其在经营资质上是合法的。但这并不直接等同于其有权在小区住宅楼一楼挂牌匾。
广告与招牌设置规定：
- 根据《中华人民共和国广告法》及相关地方性法规，广告的设置需要符合城市规划、市容市貌等要求，且通常需要经过相关部门的审批。
- 如果诊所的牌匾属于广告范畴，且未按照相关规定进行审批或设置，那么物业有权阻止其挂牌匾。
二、小区管理规约层面
管理规约的效力：
- 小区管理规约是业主共同制定的，对小区内所有业主和物业使用人具有约束力。
- 如果管理规约中明确规定了禁止在住宅楼一楼挂牌匾或限制了牌匾的设置方式、尺寸等，那么诊所作为物业使用人，应当遵守这一规定。
物业的职责：
- 物业作为小区的管理者，有责任执行管理规约，维护小区的秩序和美观。
- 如果诊所的牌匾违反了管理规约，物业有权阻止其挂牌匾，并要求其整改。
三、物业服务合同层面
合同内容的约定：
- 物业服务合同是物业与业主（或业主委员会）之间签订的，明确了双方的权利和义务。
- 如果合同中明确规定了物业有权阻止违反管理规约或法律法规的行为，包括挂牌匾等，那么物业的行为就是合法的。
物业的权限：
- 物业的权限来源于合同和管理规约，如果合同或管理规约没有赋予物业阻止挂牌匾的权限，那么物业的行为可能构成越权。
四、建议与措施
核查相关法律法规：
- 诊所应首先核查当地关于广告设置、城市规划等方面的法律法规，确保其牌匾的设置符合规定。
审查小区管理规约：
- 诊所应审查小区的管理规约，了解其中关于牌匾设置的具体规定，确保自己的行为不违反规约。
与物业沟通协商：
- 如果诊所认为自己的牌匾设置合法且符合管理规约，可以与物业进行沟通协商，说明情况并寻求解决方案。
寻求法律援助：
- 如果双方无法达成一致意见，诊所可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并采取相应的法律措施。
总结：物业是否合法阻止小区住宅楼一楼诊所挂牌匾，需根据具体情况判断。诊所应首先核查相关法律法规和小区管理规约，确保自己的行为合法合规。如果与物业存在分歧，可以通过沟通协商或寻求法律援助来解决。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。