结论：在非机动车被机动车撞且非机动车承担次要责任的情况下，非机动车通常需要按照责任比例赔偿机动车的修车费用。但具体赔偿责任和比例需根据实际情况和法律规定综合判断。
一、责任划分原则
根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条的规定，机动车与非机动车驾驶人、行人之间发生交通事故，责任划分遵循以下原则：
- 非机动车无过错：若非机动车驾驶人、行人无过错，由机动车一方承担赔偿责任。
- 非机动车有过错：若有证据证明非机动车驾驶人、行人有过错，将适当减轻机动车一方的赔偿责任，具体减轻程度依据非机动车的过错程度确定。机动车一方若无过错，其赔偿责任不超过损失的百分之十。
在您所描述的情况中，非机动车已被判定为次要责任，这意味着非机动车方需要承担一部分赔偿责任。
二、非机动车次要责任的赔付情况
责任比例分担：
- 非机动车在事故中负次要责任时，需按责任比例承担部分修车费用。例如，若非机动车被判定承担30%的责任，则需支付机动车修车费用的30%。这一比例可根据具体事故情况有所调整，但通常主次责任比例划分为主要责任方承担70%，次要责任方承担30%。
保险赔付顺序：
- 非机动车保险：若非机动车购买了相应的保险（如非机动车第三者责任险），可先由保险公司在保险限额内进行赔付。
- 机动车交强险：若机动车投保了交强险，交强险将在其赔付范围内先行赔付机动车的财产损失（通常为2000元），不足部分再由非机动车按照责任比例承担。
- 个人承担：若非机动车未购买保险或保险赔付不足，剩余部分需由非机动车驾驶人个人承担。
三、实际操作建议
及时报警与报案：
- 发生交通事故后，应立即报警并联系保险公司。交警将出具事故认定书，明确事故责任；保险公司则根据事故认定书和保险条款进行理赔。
收集证据：
- 及时收集证据、保留现场照片、医疗记录等相关资料，以便为后续的处理提供有力支持。特别是关于车辆损坏情况的照片和维修估价单，这些将作为赔偿金额的依据。
协商与调解：
- 对于非机动车一方来说，若需承担赔偿责任，应首先尝试与机动车一方进行友好协商。协商不成时，可寻求交警部门或人民调解委员会的帮助进行调解。在协商和调解过程中，保持冷静和理性，依据事实和法律进行沟通。
法律途径解决争议：
- 若协商与调解均无法达成一致，非机动车一方可通过法律途径解决争议，包括提起诉讼或申请仲裁等。在诉讼过程中，法院将根据事故责任认定、相关法律法规以及双方提供的证据来判决赔偿金额和责任比例。
四、特殊情况考量
- 非机动车经济能力：如果非机动车车主经济困难，可能无法全额赔偿机动车的损失。在这种情况下，可以与机动车车主协商分期赔偿或寻求其他解决方案。
- 机动车过错：即使非机动车被认定为主要责任方（但在此问题中为次要责任），机动车驾驶员也可能因超速、未保持安全距离等行为而承担一定的次要责任。这将在责任划分和赔偿比例上有所体现。
总结：非机动车在交通事故中承担次要责任时，确实需要按照责任比例赔偿机动车的修车费用。具体赔付金额和责任比例应根据交通事故责任认定和相关法律法规来确定。在处理这类事故时，建议保持冷静、依法依规进行协商和处理，并寻求专业法律帮助以确保自身权益得到妥善维护。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。