针对“基本农田被永久性违法占用，依照什么标准来赔偿”这一问题，以下是我的详细解答：

1. 罚款标准：

   • 破坏种植条件：根据《中华人民共和国土地管理法》第七十五条及其实施条例第五十五条，若非法占用永久基本农田并破坏种植条件，罚款额通常为耕地开垦费的10倍以上20倍以下。具体数额需根据当地耕地开垦费标准确定，因此不同地区会有所差异。
   • 逾期不改正：若非法占用永久基本农田发展林果业或挖塘养鱼，且逾期不改正的，根据《土地管理法实施条例》第五十一条，将按占用面积处耕地开垦费2倍以上5倍以下的罚款。
   • 新标准下的罚款：依据新《土地管理法实施条例》及相关规定，非法占用永久基本农田还可能面临每平方米100元以上1000元以下的罚款，这进一步体现了对违法行为的严厉打击。

2. 其他处罚措施：

   • 责令限期改正或治理：自然资源主管部门会首先责令违法者限期改正或治理，以恢复永久基本农田的种植条件。这是恢复土地原状、保护土地资源的重要措施。
   • 拆除违法建筑物：若在非法占用的土地上修建了永久性建筑物，相关部门将责令限期拆除，并可能处以额外的罚款，如土地复垦费5倍以上10倍以下的罚款。这是为了防止违法建筑对土地资源的进一步破坏。
   • 追究刑事责任：若非法占用永久基本农田的行为构成犯罪，如造成耕地大量毁坏等严重后果，或依据《刑法》第三百四十二条构成非法占用农用地罪，违法者将依法被追究刑事责任。这可能包括五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金的处罚。

3. 赔偿与恢复：

   • 除了上述罚款和处罚措施外，违法者还需承担赔偿损失的责任。赔偿范围通常包括因违法占用导致的土地价值损失、农作物损失以及恢复土地原状所需的费用等。具体赔偿数额需根据实际情况评估确定。
   • 违法者应尽快采取措施进行整改和恢复，以避免更严重的法律后果。这包括拆除违法建筑、恢复土地种植条件等。

综合建议：

• 严格遵守法律法规：所有单位和个人应严格遵守土地管理法规，不得擅自占用或改变永久基本农田的用途。这是保护土地资源、维护农业生产和粮食安全的基本要求。
• 及时整改与恢复：对于已经发生的违法行为，应尽快采取措施进行整改和恢复。这不仅可以避免更严重的法律后果，还有助于保护土地资源和生态环境。
• 加强监管与执法：政府和相关部门应加强监管和执法力度，确保土地资源的合法合规使用。对于发现的违法行为，应及时查处并依法追究责任。

如果您在基本农田保护方面遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和解决方案。