药店老板可能面临行政处罚，若构成犯罪还将承担刑事责任，同时可能面临民事赔偿等后果，具体处理需结合实际情况。以下从不同法律角度为你详细分析：
行政责任角度
- 依据及处罚规定
根据《中华人民共和国药品管理法》相关规定，药品经营企业不得在药品购销中给予、收受回扣或者其他不正当利益。药店给医生回扣这种行为违反了该规定，属于不正当竞争和商业贿赂行为。
对于这种违法行为，市场监督管理部门有权进行查处。一般会责令改正，没收违法所得，并处违法所得一倍以上三倍以下的罚款；违法所得不足五万元或者没有违法所得的，处五万元以上五十万元以下的罚款；情节严重的，吊销药品经营许可证。
- 情节认定
虽然每个人五年内回扣不到二万，但如果涉及医生人数较多，累计回扣金额较大，或者存在多次实施该违法行为、造成严重社会影响等情节，会被认定为情节严重，从而面临更严厉的处罚，如吊销药品经营许可证。
刑事责任角度
- 构成犯罪的情形
如果药店给医生回扣的行为情节严重，达到《中华人民共和国刑法》中规定的商业贿赂犯罪的立案标准，药店老板可能构成对非国家工作人员行贿罪或者行贿罪。
- 对非国家工作人员行贿罪：如果医生属于非国家工作人员，药店为谋取不正当利益，给予医生财物，数额较大的（一般六万元以上），处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大的（一般二百万元以上），处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
- 行贿罪：如果医生属于国家工作人员，药店为谋取不正当利益，给予国家工作人员以财物的，构成行贿罪。行贿数额在三万元以上的，或者行贿数额在一万元以上不满三万元，但具有向三人以上行贿、将违法所得用于行贿等情形的，应当依照刑法规定以行贿罪追究刑事责任，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；情节严重的，或者使国家利益遭受重大损失的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；情节特别严重的，或者使国家利益遭受特别重大损失的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。
- 量刑情节
在量刑时，法院会综合考虑行贿数额、次数、人数、造成的后果、认罪态度等因素。如果药店老板有自首、立功、积极退赃等情节，可能会从轻或者减轻处罚。
民事责任角度
- 合同纠纷方面
如果药店与医生所在的医疗机构之间存在药品供应合同等民事合同关系，药店的行贿行为可能构成违约。医疗机构有权依据合同约定要求药店承担违约责任，如赔偿因药店违约给医疗机构造成的损失，包括但不限于声誉损失、额外支出等。
- 侵权责任方面
药店的行贿行为可能损害了患者的合法权益，例如导致患者使用了不必要的高价药品等。患者有权要求药店承担侵权责任，赔偿其因此遭受的损失，如多支付的药品费用、因药品质量问题导致的身体损害赔偿等。
其他后果
- 行业禁入
药店老板的违法行为可能会被记录在相关信用信息系统中，影响其个人信用。在药品行业，可能会面临行业禁入等限制措施，以后难以再从事药品经营等相关行业。
- 社会声誉受损
这种违法行为一旦被曝光，药店的社会声誉会受到极大影响，导致患者对药店的信任度降低，进而影响药店的经营业绩。
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