不配合行政检查的处理方式需根据具体情形和法律规定来操作，以下是详细分析：

1. 行政机关的应对措施
   根据《行政处罚法》《行政强制法》及相关行业法规，行政机关有权要求被检查对象配合检查。若对方拒不配合，行政机关可采取以下措施：

   • 责令改正：首次可书面或口头责令限期配合，明确告知法律后果。
     
   • 强制措施：对阻碍检查的行为（如锁门、藏匿证据），可依法采取查封场所、扣押财物等强制措施，但需严格履行审批程序并出示证件。
     
   • 行政处罚：对拒不配合且情节严重的（如暴力抗法），可依据《治安管理处罚法》处以警告、罚款或拘留；若涉及特定行业（如环保、税务），还可能面临吊销许可证等处罚。
     
   • 申请法院强制执行：对拒不履行行政决定的，行政机关可向法院申请强制执行，费用由被执行人承担。

2. 被检查对象的权利与义务

   • 义务：配合检查是法定义务，包括提供资料、允许进入场所、接受询问等。
     
   • 权利：
     
     • 要求检查人员出示执法证件和检查通知书；
       
     • 对检查程序违法（如超范围检查）可提出异议；
       
     • 对处罚决定不服可申请行政复议或提起行政诉讼。
       

3. 实务建议

   • 对行政机关：
     
     • 检查前应明确法律依据和程序，避免程序瑕疵；
       
     • 对拒不配合的情形，及时固定证据（如录音录像、证人证言）；
       
     • 优先通过沟通化解矛盾，避免激化冲突。
       
   • 对被检查对象：
     
     • 若对检查合法性存疑，可要求书面说明依据，但不得直接拒绝配合；
       
     • 及时咨询律师评估风险，避免因抗法导致处罚升级；
       
     • 若认为检查侵权，可通过复议或诉讼维权，而非现场对抗。
       

总结：不配合行政检查可能面临从责令改正到行政处罚甚至刑事责任的梯度后果。行政机关需依法行使权力，被检查对象则应平衡配合义务与权利保护。具体操作中，建议根据行业法规和地方细则进一步核实程序要求。如有复杂情形，可直接向我咨询具体应对方案。