“整户消亡”的认定并非直接等同于1998年土地承包合同证书的失效，而是指承包户内最后一个具有完全民事行为能力的家庭成员去世，且无其他家庭成员继续承包土地的情形。 以下是具体分析：

1. “整户消亡”的法律含义
   根据《农村土地承包法》及相关政策，“整户消亡”通常指承包户内所有家庭成员均已去世，且无其他家庭成员（如通过婚姻、收养等关系加入）继续承包土地。此时，该户的土地承包经营权终止，土地由村集体收回。这一认定与土地承包合同的具体签订年份（如1998年）无直接关联，而是以家庭成员的存续状态为判断标准。

2. 1998年土地承包合同证书的作用
   1998年签订的土地承包合同证书是证明农户与村集体之间土地承包关系的法律文件，其有效期通常为30年（至2028年）。即使户内成员去世，只要还有其他家庭成员符合承包资格（如子女、配偶等），合同仍继续有效，由剩余家庭成员继续承包。因此，合同证书本身不会因“整户消亡”外的其他原因失效。

3. “整户消亡”后的土地处理
   若确认“整户消亡”，村集体有权收回土地，并可通过民主议定程序重新发包。实践中需注意：

   • 需严格核实家庭成员情况，避免误判（如存在隐匿的继承人或符合承包资格的成员）；
     
   • 收回土地应遵循法定程序，保障程序合法性；
     
   • 若土地已被流转或存在其他权益纠纷，需先解决纠纷再处理土地。

总结：
“整户消亡”的认定以家庭成员存续状态为核心，与土地承包合同的具体年份无关。1998年合同证书是承包关系的证明，但合同效力是否终止取决于家庭成员是否全部消亡且无其他承包人。如有具体案例或地方政策差异，可进一步向我咨询细节。