当摩托车因改装排气系统被交警查处时，车主可能会面临一系列的法律后果和处理措施。以下是对此情况的详细解答：
一、非法改装排气的认定与处罚
认定：
- 交警会根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，判断摩托车的排气系统是否属于非法改装。非法改装通常指的是改变了原有车辆的技术参数和外观特征，如更换了非原厂的排气系统，导致车辆噪音、排放等不符合标准。
处罚：
- 罚款：车主可能面临二十元以上至两千元不等的罚款，具体金额因地区和违法情节的严重程度而异。通常，根据《机动车登记规定》，擅自改变机动车外形和已登记的有关技术数据的，公安机关交通管理部门可责令恢复原状，并处警告或者五百元以下罚款。对于更严重的改装行为，罚款金额可能更高。
- 扣分：在某些地区，非法改装还可能导致驾驶证被扣分，具体扣分情况因地区和具体违法行为而有所不同，但通常为扣1分。
- 责令恢复原状：交警会要求车主在规定时间内将摩托车的排气系统恢复到出厂时的原始状态。若未能在规定时间内完成整改，车辆可能无法通过年检或被暂扣。
二、排气噪音超标的认定与处罚
认定：
- 交警会使用专业的噪音检测设备对摩托车的噪音进行现场检测。如果噪音超过国家规定的标准（如城市道路行驶的摩托车噪音排放一般不能超过70-80分贝左右），则会被认定为噪音超标。
处罚：
- 警告：对于初次发现且情节较轻的情况，交警可能会给予口头警告，并提醒车主注意排气噪音问题。
- 罚款：对于情节较为严重、多次违规或噪音严重超标的情况，车主可能会面临几十元至几百元不等的罚款处罚。
三、其他可能的法律后果
吊销驾照：
- 如果车主多次违法改装或造成严重后果，如因改装导致交通事故发生，可能会被吊销驾驶证。
刑事责任：
- 若因非法改装导致交通事故并造成人员伤亡或重大财产损失，车主可能需要承担刑事责任。
四、应对建议
遵守法规：
- 摩托车车主应严格遵守道路交通安全法律法规，避免擅自改装车辆，特别是排气系统等关键部件。
了解规定：
- 如有改装需求，车主应事先了解当地的法规和规定，确保改装行为合法合规。可以咨询专业的摩托车维修店或改装店，获取合法的改装建议。
及时整改：
- 如果被交警查处并要求整改，车主应积极配合，及时将车辆恢复至原厂状态，以避免进一步的处罚。
行政复议与诉讼：
- 对交警的处罚有异议时，车主有权在规定时间内向上一级公安机关交通管理部门或同级人民政府提出行政复议申请；也可在知道作出处罚决定之日起六个月内，直接向有管辖权的人民法院提起行政诉讼。
综上所述，摩托车因排气问题被交警查处时，车主应积极配合处理，并及时将车辆恢复至原厂状态。同时，加强对道路交通安全法律法规的学习，遵守相关规定，以确保合法合规地驾驶摩托车。