小公司收到企业涉嫌空壳的短信，首先需冷静核实信息真实性，再根据不同情况采取针对性措施，具体处理方式如下：

一、核实短信来源及内容真实性

1. 确认发送主体
   检查短信是否明确标注发送单位（如市场监管局、税务局、公安机关等）。若为匿名或非官方渠道发送，需高度警惕诈骗风险，切勿直接回复或点击链接。

2. 验证信息内容
   通过官方渠道（如政府网站、公开电话）联系发送单位，核实是否存在相关调查或通知。若短信中提及具体违法事实（如虚假注册、偷逃税款等），要求对方提供书面材料或调查依据。

二、分情况处理

情况1：短信内容不实或为诈骗

1. 保留证据
   保存短信截图、发送号码、发送时间等证据，避免删除原始信息。

2. 报警处理
   向公安机关报案，提供证据材料，协助打击诈骗行为。若短信涉及伪造公章、冒用名义等情形，可能构成刑事犯罪。

3. 加强内部管理
   检查公司注册信息、税务申报、银行账户等是否存在异常，防止被不法分子利用。

情况2：短信内容属实或部分属实

1. 配合调查
   若经核实确存在被调查事项（如注册地址异常、未实际经营等），需积极配合监管部门调查，提供相关材料（如租赁合同、经营记录等）。

2. 自查整改

   • 注册信息：确认公司注册地址、股东信息、经营范围等是否真实、有效。
     
   • 经营情况：检查是否实际开展业务，是否存在长期零申报、未开户等异常情形。
     
   • 税务合规：核对纳税申报、发票使用等是否符合规定，避免偷逃税款。
     

3. 法律风险防范

   • 若公司确为“空壳公司”（无实际经营、无资产、无人员），可能面临被吊销营业执照、列入严重违法失信名单等风险，需及时办理注销或转型。
     
   • 若被认定为“虚假注册”或“虚开发票”，可能涉及行政处罚甚至刑事责任，需立即停止违法行为并咨询专业律师。

三、长期合规建议

1. 完善公司治理
   确保公司注册信息真实、完整，避免使用虚假地址或冒用他人身份注册。

2. 保持经营痕迹
   保留合同、发票、银行流水等经营证据，证明公司实际开展业务。

3. 定期税务申报
   即使无收入，也需按期进行零申报，避免被认定为“非正常户”。

4. 咨询专业律师
   若对短信内容或公司合规性存在疑问，可直接向我咨询，我将结合具体情形提供法律意见。