结论：机关单位“未批先建”的行为通常不能免于处罚，且可能面临一系列法律后果。不过，在特定条件下，若能及时补办手续并符合相关规定，可能减轻或避免部分处罚，但完全免于处罚的情况较为罕见。
一、法律层面的要求与处罚
法律依据：
- 根据《中华人民共和国建筑法》第六十四条，未取得施工许可证或者开工报告未经批准擅自施工的，责令改正，对不符合开工条件的责令停止施工，可以处以罚款。
- 《建设工程质量管理条例》第五十七条也规定，建设单位未取得施工许可证或者开工报告未经批准，擅自施工的，责令停止施工，限期改正，处工程合同价款1%以上2%以下的罚款。
- 此外，《中华人民共和国城乡规划法》、《中华人民共和国土地管理法》以及《中华人民共和国环境影响评价法》等法律法规，也对“未批先建”行为设定了相应的处罚措施。
具体处罚：
- 处罚措施可能包括责令停止建设、罚款、责令恢复原状（如拆除违法建筑、恢复土地原状等）。
- 罚款的数额根据违法行为的性质、情节及后果，以及相关法律法规的规定综合判定，可能涉及工程合同价款的一定比例、非法占用土地每平方米的罚款额，或者建设项目总投资额的一定比例等。
二、特殊情况下的处理
补办手续：
- 在某些情况下，如果机关单位在“未批先建”后能够及时补办相关审批手续，并符合相关法律法规的要求，可能减轻或避免部分处罚。
- 但这并不意味着可以完全免于处罚，因为“未批先建”行为本身已经违反了法律法规，且可能已经对环境、规划等造成了不良影响。
整改与审查：
- 即使决定不予处罚或减轻处罚，机关单位也必须按照法律规定对违法行为进行整改，如停止建设活动、补充编制环境影响评价文件等，以消除违法状态。
- 审批机关会对整改情况进行严格审查，确保项目符合合法合规的基本要求后，才可能考虑给予审批或减轻处罚。
三、实际操作建议
严格遵守法律法规：
- 机关单位在进行任何建设项目之前，务必依法进行环境影响评价、规划许可、施工许可等审批手续，确保项目的合法性和合规性。
及时整改与沟通：
- 对于已存在的“未批先建”项目，机关单位应尽快采取措施进行整改，并积极与审批机关沟通，说明情况并寻求合法的解决方案。
- 在整改过程中，应严格按照法律法规的要求进行，确保整改措施的有效性和合法性。
寻求专业法律支持：
- 在处理“未批先建”问题时，机关单位可以寻求专业律师的法律支持，以确保自身权益得到充分保障。
- 律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案，帮助机关单位更好地应对法律挑战。
总结：机关单位“未批先建”的行为通常不能免于处罚，但特定条件下若能及时补办手续并符合相关规定，可能减轻或避免部分处罚。为避免不必要的法律风险和经济损失，建议机关单位严格遵守相关法律法规，确保项目的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律支持，请直接向我咨询。