软件著作权在登记时，对著作权人的数量没有限制，可以挂多个公司的名字，但具体归属和行使方式需根据开发情境和合作开发者之间的协议来确定。以下从不同角度进行详细分析：
著作权人数量无限制：
- 根据我国《计算机软件保护条例》及相关法律规定，软件著作权的登记并不限制著作权人的数量。无论是单个公司、多个公司联合，还是公司与自然人等其他主体的合作，均可以作为著作权人进行合法登记。这意味着，在软件著作权的登记上，主体数量不是问题，关键在于明确各方的权益和责任。
合作开发的著作权归属：
- 当两个以上的公司或其他主体合作开发软件时，著作权的归属首先由合作开发者之间签订的书面合同来约定。这是双方意思自治的体现，也是确保合作双方权益得到明确划分的关键。
- 若无书面合同，或合同中未对著作权归属作出明确规定，则合作开发的软件著作权由各合作开发者共同享有。此时，任何一方在行使除转让权以外的其他权利时，不得损害其他合作者的利益，且所得收益应合理分配给所有合作开发者。
委托开发下的著作权归属：
- 在软件开发过程中，若存在接受其他公司委托的情况，软件的著作权归属需根据双方的合同约定来确定。这强调了合同在委托开发中的重要性，双方应通过明确的合同条款来保护各自的权益。
- 如无明确的书面合同，或合同中未就著作权归属进行约定，则著作权默认归属于受托人，即实际完成开发工作的一方。但这种情况较为少见，且容易引发纠纷，因此建议委托开发时务必签订书面合同。
实际操作中的建议：
- 签订书面合同：为避免后续纠纷，合作开发者或委托方与受托方应签订书面合同，明确约定著作权的归属及各方权利义务。这是保障各方权益的基础。
- 实名认证与申请材料：所有著作权人都需进行实名认证，并提交相应的申请材料。如果著作权人数量过多，可能会增加申请流程的复杂性和管理难度，因此建议合理确定著作权人的数量。
- 权益保障：在确定著作权人时，应确保各方的权益得到合理保障，包括但不限于使用权、收益分配权等。这是维护合作稳定性和持续性的关键。
举例说明：
假设有两家公司A和B合作开发了一款软件，双方在合作前签订了书面合同，明确约定该软件的著作权由A公司和B公司共同享有。那么，在软件著作权登记时，A公司和B公司都可以作为著作权人进行登记。如果双方没有签订书面合同，或者合同中没有明确约定著作权的归属，那么根据法律规定，该软件的著作权将由A公司和B公司共同享有。
后续行动建议：
如果你正在考虑与他人合作开发软件或委托他人开发软件，建议你在合作或委托前务必签订详尽的合同，明确著作权的归属和行使方式。这样不仅可以避免未来的法律纠纷，还可以确保你的权益得到充分保障。如果你在软件著作权登记或合作开发过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询。