关于“百千万工程捐赠是否合法”的问题，结论需分情况讨论，具体如下：

1. 若捐赠行为符合法律法规及政策要求，则合法
   “百千万工程”若属于政府主导的公益项目（如乡村振兴、扶贫开发等），企业或个人通过合法渠道向该项目捐赠资金、物资或提供服务，通常受法律保护。根据《中华人民共和国公益事业捐赠法》规定，捐赠应当自愿、无偿，且捐赠财产的使用需符合公益目的，不得挪作他用。若捐赠方与受赠方签订书面协议明确权利义务（如捐赠用途、管理方式等），并依法履行备案或审批程序（如涉及大额捐赠或特定领域），则捐赠行为合法有效。

2. 若捐赠行为存在以下情形，则可能违法：

   • 未通过合法渠道捐赠：若捐赠方绕过政府或指定接收单位，直接向个人或非公益组织捐赠，且资金未用于“百千万工程”指定用途，可能涉嫌挪用资金或诈骗。
     
   • 捐赠财产来源不合法：若捐赠资金或物资涉及洗钱、贪污等违法所得，捐赠行为可能被认定为非法转移赃款，需承担刑事责任。
     
   • 强制捐赠或变相摊派：根据《公益事业捐赠法》，任何组织或个人不得以行政命令、摊派等方式强制捐赠。若“百千万工程”实施中存在此类行为，捐赠方可拒绝并投诉。
     
   • 未履行税务或备案义务：企业捐赠若未按规定申报税前扣除，或大额捐赠未向相关部门备案，可能面临税务处罚或行政纠正。

3. 特殊情形：政府与企业合作模式下的捐赠
   若“百千万工程”采用“政府引导、企业参与”的PPP模式（如社会资本投资基础设施），企业投入资金可能被认定为投资而非捐赠。此时需区分合同性质：若合同明确约定企业不享有项目收益权，仅以公益为目的，则可能被认定为捐赠；若企业通过项目运营获得收益，则属于投资行为，需遵守《民法典》合同编及PPP相关法规。

法律建议：

• 捐赠前核实“百千万工程”的实施主体是否为政府或合法公益组织，要求受赠方出示相关批准文件或备案证明。
  
• 签订书面捐赠协议，明确捐赠用途、管理方式、违约责任等条款，避免口头约定。
  
• 保留捐赠凭证（如转账记录、物资签收单等），以便后续监督资金使用情况。
  
• 若发现捐赠被挪用或存在违法行为，可向民政部门、审计机关或公安机关举报。

示例：
某企业向“百千万工程”捐赠100万元用于修建乡村道路，若该工程由县政府主导，企业与县慈善总会签订协议并转账至指定账户，且道路建成后公开使用情况，则捐赠合法；若企业直接将资金交给村干部个人，且道路未实际修建，则可能涉嫌违法。

如有具体捐赠场景或合同条款需审查，可直接向我咨询，我会结合细节进一步分析。