代收代付做账使用复印件的合法性，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度为你详细分析：
合法使用复印件的情形
符合财务和税务规定：
- 在某些情况下，如果原件难以获取或保存成本过高，且复印件能够清晰、准确地反映交易的真实情况，同时符合财务和税务部门的相关规定，那么使用复印件进行做账可能是被允许的。例如，一些小额、频繁的代收代付业务，如果每次交易都有详细的电子记录或银行流水作为佐证，且复印件与这些记录一致，那么使用复印件做账在实务中可能被接受。
内部审批和备案：
- 如果公司内部有完善的审批和备案流程，对于使用复印件进行做账的情况有明确的规范和要求，并且这些规范和要求得到了财务和税务部门的认可，那么在这种情况下使用复印件做账也是合法的。这要求公司必须建立严格的内部控制制度，确保复印件的真实性和准确性。
非法使用复印件的情形
伪造或篡改复印件：
- 如果为了掩盖真实的交易情况或逃避税务等监管，而伪造或篡改复印件，那么这种行为显然是违法的。这不仅违反了财务和税务规定，还可能构成欺诈等犯罪行为。
未按规定保存原件：
- 即使使用了复印件进行做账，但如果未按规定保存原件，或者在需要时无法提供原件进行核对，那么这种行为也可能被视为违法。因为原件是交易真实性的最直接证据，无法提供原件可能会引发对交易真实性的质疑。
违反特定行业规定：
- 某些特定行业（如金融、医疗等）可能对做账的凭证有更为严格的要求，可能明确规定必须使用原件进行做账。在这种情况下，如果使用复印件进行做账，就可能违反行业规定，面临相应的法律后果。
法律建议
尽量使用原件：
- 为了确保做账的合法性和准确性，建议尽量使用原件进行做账。如果确实需要使用复印件，应确保复印件的真实性和准确性，并符合财务和税务部门的相关规定。
完善内部控制制度：
- 公司应建立完善的内部控制制度，规范做账流程，明确复印件的使用条件和审批程序。这有助于降低使用复印件做账的风险，确保公司的财务和税务合规。
咨询专业人士：
- 如果对代收代付做账使用复印件的合法性有疑问，建议咨询专业的财务或税务人士，或者向我这样的专业律师咨询。他们可以根据具体情况提供针对性的法律建议，帮助公司规避潜在的法律风险。
总之，代收代付做账使用复印件的合法性并非绝对，而是需要根据具体情况来判断。为了确保公司的财务和税务合规，建议尽量使用原件进行做账，并在必要时咨询专业人士的意见。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。