结论：公司规定迟到扣钱是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 合法情形：

   • 规章制度合法有效：若公司规章制度中明确规定了迟到扣钱的条款，且该规章制度已经过民主程序制定（如职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定），并向劳动者进行了公示或告知，那么该规章制度对劳动者具有约束力。在此情况下，公司依据合法有效的规章制度对迟到员工进行扣钱，是合法的。
   • 扣钱幅度合理：即使规章制度合法有效，扣钱的幅度也需合理。一般来说，扣钱金额不应超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。若扣钱幅度超出此范围，则可能被视为违法。

2. 违法情形：

   • 规章制度未经过民主程序或未公示告知：若公司规章制度未经过民主程序制定，或未向劳动者进行公示或告知，那么该规章制度对劳动者不具有约束力。在此情况下，公司依据该规章制度对迟到员工进行扣钱，是违法的。
   • 扣钱幅度不合理：如前所述，若扣钱金额超过劳动者当月工资的20%，或扣除后的剩余工资低于当地最低工资标准，则扣钱行为违法。
   • 以扣钱代替管理：公司不能仅以扣钱作为管理员工的唯一手段。若公司未采取其他合理的管理措施（如提醒、警告、培训等），而直接对迟到员工进行扣钱，且扣钱行为缺乏合理性和必要性，那么该行为可能被视为违法。

法律建议：

• 对于公司而言，应确保规章制度的合法性和有效性，明确迟到扣钱的条款，并经过民主程序制定和公示告知。同时，扣钱幅度应合理，不得超过法定范围。
• 对于劳动者而言，若认为公司扣钱行为违法，可先与公司进行协商沟通，要求公司说明扣钱的依据和合理性。若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 若公司扣钱行为违法，劳动者有权要求公司返还被扣的工资，并可能获得相应的经济补偿。
• 若公司因扣钱行为引发劳动争议，可能面临劳动监察部门的处罚或劳动仲裁机构的裁决，影响公司的声誉和正常运营。

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