专属管辖和协议管辖的主要区别体现在以下几个方面：
定义与性质：
- 专属管辖：是指法律强制规定某类案件必须由特定的法院管辖，当事人不能以协议的方式改变这种管辖。它体现了法律的强制性和排他性，确保某些特定类型的案件由具有专业知识和经验的法院来审理。
- 协议管辖：则是指双方当事人在合同纠纷或者其他财产权益纠纷发生之前或发生之后，以协议的方式选择解决他们之间纠纷的管辖法院。它体现了当事人的意思自治，允许当事人根据自身的需要和便利来选择管辖法院。
适用范围：
- 专属管辖：通常适用于一些特定的、具有重大社会影响的案件，如因不动产纠纷提起的诉讼、因港口作业中发生纠纷提起的诉讼等。这些案件往往涉及到公共利益或特定领域的专业知识，因此法律强制规定由特定的法院管辖。
- 协议管辖：则主要适用于合同纠纷或者其他财产权益纠纷。在这些纠纷中，当事人通常具有平等的地位，且纠纷的性质相对较为简单，因此允许当事人通过协议的方式选择管辖法院。
法律效力：
- 专属管辖：具有强制性和排他性，一旦法律对某类案件规定了专属管辖，那么这类案件就必须由法律规定的法院管辖，当事人不能通过协议改变这种管辖。如果当事人违反专属管辖的规定，选择了其他法院进行诉讼，那么该法院将不具有管辖权，且可能因此导致诉讼程序无效。
- **协议管辖：虽然也具有一定的法律效力，但其效力受到法律的限制。例如，协议管辖不得违反级别管辖和专属管辖的规定，否则协议将无效。此外，协议管辖的法院必须是与纠纷有实际联系的地点的法院，且协议必须采用书面形式。
实际应用中的考虑：
- 在选择管辖法院时，当事人应首先考虑是否存在专属管辖的规定。如果存在，则必须遵守该规定，选择法律规定的法院进行诉讼。
- 如果不存在专属管辖的规定，且纠纷属于合同纠纷或其他财产权益纠纷，那么当事人可以考虑通过协议的方式选择管辖法院。在选择时，应综合考虑各种因素，如法院的专业水平、地理位置、诉讼成本等。
举例说明：
假设有一起不动产纠纷案件，根据法律规定，这类案件应由不动产所在地的法院专属管辖。那么，无论当事人之间是否有协议管辖的约定，该案件都必须由不动产所在地的法院进行审理。
再假设一起合同纠纷案件，双方当事人在合同中约定了由某地的法院进行管辖。只要该约定不违反级别管辖和专属管辖的规定，且该法院与纠纷有实际联系，那么该约定就是有效的。在发生纠纷时，当事人就可以按照约定向该法院提起诉讼。
总结与建议：
专属管辖和协议管辖在定义、性质、适用范围和法律效力等方面都存在明显的区别。在实际应用中，当事人应根据具体情况选择合适的管辖方式。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。