针对您提出的“水库内建违章建筑物怎么处理”的问题，这是一个涉及水务管理和行政处罚的复杂问题。以下是我根据相关法律法规和政策，为您提供的详细解答：
一、法律依据
首先，我们需要明确的是，水库及其管理范围内的建设活动受到《中华人民共和国水法》、《中华人民共和国防洪法》以及相关地方性法规和规章的严格规范。这些法律法规明确禁止在河道、湖泊（包括水库）管理范围内建设妨碍行洪的建筑物、构筑物。
二、处理流程
发现与立案：
- 水务管理部门或相关执法机构在巡查、举报或其他途径发现水库内存在违章建筑物时，会进行初步审查，并决定是否立案。
调查取证：
- 立案后，执法机构会指定专人负责，组织调查取证。调查过程中，执法人员会出示执法证件，听取当事人辩解陈述，并作记录。同时，他们会确保调查的公正性和保密性。
审查与告知：
- 执法机构会审查案件调查报告，对违法事实、证据、调查取证程序、法律适用等方面进行全面审查。
- 在作出行政处罚决定前，会制作《行政处罚通知书》送达当事人，告知其违法事实及享有的陈述、申辩等权利。如果符合听证规定，还会制作并送达《行政处罚听证告知书》。
决策与决定：
- 对于重大行政处罚，执法机构会依照相关规定进行集体讨论，作出具体处罚内容的决策。
- 然后，制作行政处罚决定书，载明行政处罚告知、当事人陈述申辩或者听证情况等内容。
送达与执行：
- 行政处罚决定书会按法律规定的方式送达当事人。
- 当事人需在规定期限内履行处罚决定，如拆除违章建筑物、恢复原状等。如果逾期不履行，执法机构会依法采取强制执行措施，如强行拆除，并由违法单位或个人承担所需费用。
三、处罚措施
根据《中华人民共和国水法》和《中华人民共和国防洪法》的相关规定，对于在河道、湖泊（包括水库）管理范围内建设妨碍行洪的建筑物、构筑物的行为，执法机构可以采取以下处罚措施：
- 责令停止违法行为，限期拆除违法建筑物、构筑物，恢复原状。
- 逾期不拆除、不恢复原状的，强行拆除，所需费用由违法单位或个人负担。
- 并处一万元以上十万元以下的罚款（具体罚款数额根据违法情节和后果严重程度确定）。
四、建议与提醒
- 如果您发现水库内存在违章建筑物，建议及时向当地水务管理部门或相关执法机构举报。
- 对于已经存在的违章建筑物，当事人应尽快与执法机构沟通，了解处罚决定和整改要求，并积极配合整改工作。
- 在未来的建设活动中，务必遵守相关法律法规和政策要求，确保建设活动的合法性和安全性。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。