停业整顿期间工资发放需根据具体情况确定，核心原则是保障劳动者基本权益，同时结合企业实际经营状况和停业原因综合判断。以下是具体分析：

1. 因企业自身原因停业整顿
   若企业因经营不善、管理问题等自身原因主动停业整顿，在停业整顿的第一个工资支付周期内（通常为1个月），企业应按劳动合同约定的标准全额支付工资。
   若停业整顿超过一个工资支付周期，且劳动者提供了正常劳动（如参与整顿工作），企业支付的工资不得低于当地最低工资标准；若劳动者未提供正常劳动（如完全停工），企业应按不低于当地最低工资标准的70%支付生活费（具体比例可能因地区政策略有差异，需以当地规定为准）。

2. 因不可抗力或政府命令停业整顿
   若企业因自然灾害、疫情等不可抗力，或政府要求（如环保整改、安全检查等）被迫停业整顿，工资发放规则与上述“企业自身原因”类似：

   • 第一个工资支付周期内按合同约定支付；
     
   • 超过一个周期后，根据劳动者是否提供劳动，分别按最低工资标准或70%生活费支付。
     但需注意：若政府文件明确要求停业期间工资支付标准（如疫情期间部分地区规定“停工停产期间按最低工资80%支付”），则以政府文件为准。

3. 特殊情形：企业与劳动者协商一致
   若企业与劳动者通过协商（如集体协商、签订补充协议）对停业整顿期间工资支付达成一致（如延期支付、部分支付等），只要不违反法律强制性规定（如低于最低工资标准），该约定有效。但企业需保留协商证据（如书面协议、会议记录等），避免后续纠纷。

建议：

• 企业应提前制定停业整顿期间的工资支付方案，并与劳动者或工会沟通；
  
• 劳动者若发现企业未依法支付工资，可先与企业协商，协商不成可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁；
  
• 具体操作需结合当地工资支付条例（如《江苏省工资支付条例》《广东省工资支付条例》等）执行，不同地区可能有细化规定。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的处理方式。