结论：干了三个月但劳动合同未盖章，合同是否有效需分情况讨论，一般来说，若双方已实际履行合同主要义务，合同可能被认定为有效；但若存在争议或合同未满足法定生效条件，则可能被视为无效或部分无效。

详细分析：

1. 合同生效的一般原则：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。对于劳动合同而言，其生效通常需要满足双方意思表示真实、合同内容合法合规以及合同形式符合法律规定等条件。

2. 未盖章劳动合同的效力：

   • 情况一：双方已实际履行合同主要义务：
     • 如果劳动合同虽然未盖章，但双方已经实际履行了合同的主要义务（如劳动者提供了劳动，用人单位支付了工资等），且双方对此均无异议，那么根据《民法典》中关于合同履行的相关规定，该合同可能被视为有效。因为此时双方的行为已经表明了他们愿意受合同约束的意愿，盖章只是形式上的要求。
   • 情况二：合同存在争议或未满足法定生效条件：
     • 如果劳动合同未盖章，且双方对合同内容存在争议，或者合同本身存在违法违规的条款，或者未满足其他法定生效条件（如未经过必要的审批程序等），那么该合同可能被视为无效或部分无效。在这种情况下，未盖章可能成为合同无效的一个理由，但并非唯一理由。

3. 法律建议：

   • 对于劳动者：
     • 如果发现劳动合同未盖章，首先应与用人单位沟通，要求补盖公章或确认合同效力。如果用人单位拒绝或无法联系，劳动者可以收集相关证据（如工资条、工作证、考勤记录等）证明自己与用人单位存在劳动关系，并在必要时向劳动仲裁机构或法院申请确认劳动关系或主张相关权益。
   • 对于用人单位：
     • 用人单位应尽快与劳动者补签并盖章劳动合同，以避免潜在的法律风险。如果因特殊原因无法及时盖章，也应与劳动者达成书面协议，明确双方的权利和义务，并尽快完成盖章手续。

4. 可能的法律后果：

   • 如果劳动合同被认定为无效或部分无效，双方可能需要根据实际情况承担相应的法律责任。例如，用人单位可能需要支付未签订书面劳动合同的双倍工资差额、补缴社会保险费等；劳动者可能需要返还已领取的非法所得等。

进一步思考：

• 在实际操作中，劳动合同的盖章问题往往与合同的签订、履行和争议解决等环节紧密相连。因此，建议双方在签订劳动合同时，务必确保合同内容合法合规、条款清晰明确，并尽快完成盖章手续，以避免不必要的法律风险。
• 如果遇到劳动合同未盖章等争议问题，建议及时咨询专业律师或劳动仲裁机构，以便更好地维护自己的合法权益。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。