结论：银行在车贷贷款5年已还三年的情况下收取违约金，是否合法需视贷款合同中的具体约定以及相关法律法规来确定。

详细分析：

1. 合同约定：

   • 首先，要查看您与银行签订的车贷贷款合同中是否有关于提前还款及违约金的条款。如果合同中明确规定了提前还款需要支付违约金，并且您在签订合同时已经知晓并同意这一条款，那么银行收取违约金就是合法的。
   • 如果合同中没有明确规定提前还款需要支付违约金，或者规定不明确，那么银行收取违约金就可能缺乏合同依据，此时您可以与银行协商，要求不支付或减少违约金。

2. 相关法律法规：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。但是，违约金的数额应当合理，不得过分高于造成的损失。
   • 如果银行收取的违约金过高，超出了合理范围，您有权向法院或仲裁机构请求予以适当减少。

3. 实际操作建议：

   • 查看合同：首先，仔细阅读您的车贷贷款合同，特别是关于提前还款和违约金的条款。
   • 与银行协商：如果合同中有违约金条款，但您认为违约金过高或不合理，可以与银行进行协商，尝试达成一个双方都能接受的解决方案。
   • 寻求法律帮助：如果协商无果，或者您对合同条款有疑问，可以咨询专业律师（即我，邢牧嵩律师，专注于刑事辩护、经济纠纷等多个领域），了解您的法律权益和可能的救济途径。

可能的情况与后果：

• 如果合同有约定且合法：您可能需要按照合同约定支付违约金。但如前所述，如果违约金过高，您可以寻求法律帮助来减少支付金额。
• 如果合同无约定或约定不明确：银行收取违约金可能缺乏依据，您可以与银行协商不支付或减少违约金，甚至通过法律途径来维护自己的权益。

总结与建议：

银行在车贷贷款中收取违约金是否合法，主要取决于贷款合同中的具体约定以及相关法律法规。我建议您首先查看合同条款，然后与银行进行协商。如果协商无果或您对合同条款有疑问，可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。