结论：半夜起床尿到别人水杯里的行为，可能涉及违法，具体需根据行为的性质、后果以及行为人的主观意图等因素综合判断。以下从不同角度进行分析：
从侵权责任法的角度：
- 如果该行为导致水杯主人因饮用被污染的水而身体受到伤害，那么行为人可能构成对他人健康权的侵害。根据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的规定，行为人需要承担相应的民事赔偿责任，包括赔偿医疗费、护理费、交通费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。
- 即便该行为没有直接导致水杯主人身体受伤，但如果水杯主人因此遭受了精神上的痛苦或困扰，如感到恶心、恐惧等，且这种精神损害达到了一定的程度，行为人也可能需要承担一定的精神损害赔偿责任。不过，精神损害赔偿的认定通常较为严格，需要综合考虑多种因素。
从治安管理处罚法的角度：
- 如果该行为被认定为故意扰乱公共秩序或侵犯他人隐私（如在水杯主人不知情的情况下进行），且情节较轻，尚未构成犯罪，那么行为人可能面临治安管理处罚，如警告、罚款或拘留等。具体处罚措施会根据行为的严重程度和当地的相关规定来确定。
从刑事责任的角度：
- 在极少数情况下，如果该行为被认定为具有严重的社会危害性，且符合相关犯罪构成要件，如故意伤害罪（如果导致水杯主人身体受到严重伤害）、侮辱罪（如果行为具有侮辱性质且情节严重）等，那么行为人可能面临刑事责任的追究。不过，这种情况相对较为罕见，需要具体分析行为的性质和后果。
建议：
- 无论从哪个角度来看，半夜起床尿到别人水杯里的行为都是不恰当且可能违法的。因此，我建议你避免进行此类行为，以免给自己和他人带来不必要的麻烦和损失。
- 如果你已经进行了此类行为，并且担心可能面临的法律责任，我建议你尽快与水杯主人沟通，表达歉意并寻求和解。如果水杯主人已经报警或采取了其他法律措施，我建议你积极配合相关部门的调查和处理工作，并考虑咨询专业律师以获取更具体的法律建议。
后续思考：
- 在日常生活中，我们应该尊重他人的权益和感受，避免进行任何可能侵犯他人权益或扰乱公共秩序的行为。
- 如果遇到类似的情况或纠纷，我们应该保持冷静和理性，通过合法途径来解决问题，而不是采取过激或违法的行为来应对。
如果你有任何关于侵权损害或其他法律问题的疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。