结论：甲方是否有权扣回因错算而多给乙方的款项，需根据具体情况判断，主要包括是否构成重大误解、双方是否有相关约定以及乙方的态度等因素。以下从不同角度进行分析：
一、从合同法的重大误解角度分析
重大误解的定义：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，重大误解是指行为人因对行为的性质、对方当事人、标的物的品种、质量、规格和数量等的错误认识，使行为的后果与自己的意思相悖，并造成较大损失的。
甲方错算是否构成重大误解：
- 如果甲方在合作过程中，由于计算错误或理解错误，导致多给了乙方款项，且这种错误是明显的、重大的，且甲方在做出该行为时并不知情，那么可能构成重大误解。
重大误解的法律后果：
- 因重大误解订立的合同，一方有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销。如果甲方能够证明其错算构成重大误解，那么甲方有权要求撤销或变更相关合同条款，从而扣回多给的款项。
二、从双方约定角度分析
合同中的相关条款：
- 如果甲乙双方在合作合同中明确约定了关于款项计算、支付及错误处理的相关条款，那么应首先遵循合同约定。
无约定时的处理：
- 如果合同中没有相关约定，那么双方应协商解决。甲方可以与乙方沟通，说明错算的情况，并请求乙方返还多给的款项。
三、从乙方的态度和行为角度分析
乙方同意返还：
- 如果乙方同意返还多给的款项，那么问题可以顺利解决。双方可以签订补充协议，明确返还的金额、方式和时间等。
乙方拒绝返还：
- 如果乙方拒绝返还多给的款项，甲方可以考虑通过法律途径解决。甲方可以收集相关证据，如合同、支付凭证、错算证明等，向人民法院提起诉讼或申请仲裁，要求乙方返还多给的款项。
四、实际操作建议
收集证据：
- 甲方应尽快收集相关证据，以证明其错算的情况和多给乙方的款项金额。这些证据可能包括合同、支付凭证、计算过程记录、沟通记录等。
与乙方沟通：
- 在采取法律行动之前，甲方应尝试与乙方进行沟通，说明错算的情况，并请求乙方返还多给的款项。这有助于维护双方的合作关系，并可能避免不必要的法律纠纷。
寻求法律帮助：
- 如果沟通无果或乙方拒绝返还，甲方应寻求专业的法律帮助。作为专业律师，我可以为甲方提供法律咨询、起草法律文件、代理诉讼或仲裁等法律服务，以维护甲方的合法权益。
总结：甲方是否有权扣回因错算而多给乙方的款项，需根据具体情况判断。如果构成重大误解、双方有相关约定或乙方同意返还，那么甲方有权扣回；如果乙方拒绝返还且无法通过协商解决，甲方可以考虑通过法律途径解决。在实际操作中，甲方应收集证据、与乙方沟通并寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。