当破产清算过程中公司不配合时，可以采取以下措施来应对，以确保破产程序的顺利进行和债权人合法权益的保护：

1. 沟通协商

   • 主动沟通：首先，尝试与公司的相关负责人或破产管理人进行沟通，明确告知其应履行的配合义务，如提供财务资料、协助清算等。了解不配合的具体原因，可能是对清算程序不了解、存在误解，或者是基于自身利益考虑有其他诉求。
   • 协商解决方案：在了解原因的基础上，尝试与股东协商解决方案。如果股东的诉求合理且可行，在不损害其他债权人和股东利益的前提下，可以考虑适当调整清算方案。例如，对于股东提出的关于资产分配方式的合理建议，清算组可以进行评估和研究，若能平衡各方利益，可采纳该建议以换取股东的配合。

2. 法律文书送达与法院责令

   • 法律文书送达：若沟通无果，应通过合法的法律文书送达方式（如邮寄、公告等）向公司送达相关法律文件，要求其配合破产程序。确保送达程序的合法性，为后续的法律行动奠定基础。
   • 法院责令与处罚：如公司仍不配合，可向法院申请责令其配合，并要求公司相关人员履行义务。法院有权对拒不配合的公司采取罚款、拘留等强制措施。情节严重构成犯罪的，还可依法追究刑事责任，如“妨害清算罪”。

3. 申请法院强制执行

   • 法院可根据申请，对公司采取查封、扣押、拍卖财产等强制执行措施，以迫使公司履行配合义务。同时，法院将监督破产程序的进行，确保债权人的合法权益得到保护。例如，在某公司破产清算案件中，一名股东拒不交出公司的重要账册，影响清算工作的进行。清算组向法院申请强制执行，最终法院责令该股东限期交出账册，否则将承担相应的法律责任。

4. 推定不利事实与管理人强制接管

   • 推定不利事实：对于因公司不配合而无法查明的事实，法院有权作出对该公司不利的推定。例如，若公司拒不提供完整财务账册，法院可能根据债权人主张的资产状况进行认定。
   • 管理人强制接管：管理人在法院的支持下，可通过强制手段接管公司的财产、印章、账簿等资料。相关部门和单位有义务协助管理人，以确保接管工作的顺利进行。

5. 追究法律责任与寻求专业帮助

   • 追究法律责任：对于恶意拒不配合的公司及其相关责任人，可依据《中华人民共和国企业破产法》等相关法律规定，追究其法律责任，如拒不执行判决、裁定罪等。同时，要求其承担因拒不配合而产生的额外费用，如律师费、诉讼费等。
   • 寻求专业法律帮助：如果自身处理困难，建议聘请专业的律师或破产清算机构协助处理。他们具备丰富的法律知识和实践经验，能够制定更合理的解决方案，有效应对公司不配合的情况。

6. 借助外部力量推动

   • 请求政府部门协调：可以向相关的政府部门，如工商行政管理部门、行业主管部门等反映情况，请求他们出面协调解决。政府部门具有行政权威和资源，能够对公司施加一定的压力，促使其配合清算工作。
   • 引入专业机构辅助：考虑聘请专业的律师事务所、会计师事务所等机构，协助处理与不配合公司之间的问题。这些专业机构具有丰富的经验和专业知识，能够提供更有效的解决方案和法律支持。

在实际操作中，应根据具体情况灵活选择和应用上述措施。例如，如果公司不配合的程度较轻，且存在沟通协商的空间，那么应优先尝试通过沟通协商来解决问题；如果公司不配合的程度较重，且已经严重影响了破产程序的进行，那么应考虑采取更严厉的法律措施来应对。

最后，需要强调的是，破产清算程序是一个复杂而严谨的法律过程，需要专业的法律知识和实践经验来支持。因此，在处理公司不配合的问题时，建议咨询并委托专业的律师或破产清算机构来协助处理，以确保破产程序的顺利进行和债权人合法权益的最大化保护。