针对政府部门不配合国有企业纪检部门工作的情况，可以从以下几个角度进行分析和应对：

1. 明确法律框架与职责定位：

   • 首先，需要明确国有企业纪检部门与政府部门在法律框架下的各自职责。国有企业纪检部门主要负责企业内部纪律检查和监督，确保企业运营合规；而政府部门则依据法律法规对国有企业进行外部监管。两者虽职责不同，但目标一致，均旨在促进国有企业的健康发展。
   • 若政府部门不配合，可能涉及对职责理解不清或存在误解。此时，国有企业纪检部门应主动与政府部门沟通，明确各自职责，寻求共识。

2. 沟通协调与信息共享：

   • 沟通是解决问题的关键。国有企业纪检部门应积极与政府部门建立有效的沟通机制，定期交流工作进展，共享相关信息。
   • 在沟通过程中，应强调合作的重要性，说明不配合可能带来的负面影响，如影响企业运营效率、损害企业形象等。
   • 同时，也要倾听政府部门的意见和诉求，寻求双方都能接受的解决方案。

3. 寻求上级支持或第三方调解：

   • 若直接沟通无果，国有企业纪检部门可考虑向上级主管部门或相关领导汇报情况，寻求支持。上级部门或领导通常具有更高的权威性和协调能力，能够更有效地推动问题的解决。
   • 另一种方式是寻求第三方调解，如邀请行业协会、专家学者等介入，提供中立意见和建议，帮助双方达成共识。

4. 法律途径与救济措施：

   • 在极端情况下，若政府部门的行为严重违反了法律法规或损害了国有企业的合法权益，国有企业纪检部门可考虑通过法律途径维护自身权益。
   • 这可能包括提起行政诉讼、申请行政复议等。但在此之前，应充分评估法律风险和成本，确保行动的合法性和有效性。

5. 加强内部建设与外部监督：

   • 国有企业纪检部门应加强自身建设，提高专业能力和工作效率，确保能够及时发现和纠正企业内部的问题。
   • 同时，也应积极接受外部监督，包括政府部门的监管和社会公众的监督，以增强透明度和公信力。

具体建议：

• 在处理此类问题时，国有企业纪检部门应保持冷静和理性，避免情绪化或过激行为。
• 注重证据收集和整理，确保在沟通或法律途径中能够提供有力的支持。
• 积极寻求专业法律意见，确保行动的合法性和有效性。

可能面临的法律后果：

• 若政府部门的行为确实违反了法律法规，可能面临行政责任或刑事责任的追究。
• 国有企业若因政府部门不配合而遭受损失，也有权要求政府部门承担相应的赔偿责任。

总结：政府部门不配合国有企业纪检部门工作是一个复杂而敏感的问题，需要从多个角度进行分析和应对。通过明确法律框架、加强沟通协调、寻求上级支持或第三方调解、采取法律途径以及加强内部建设与外部监督等措施，可以有效地推动问题的解决并维护国有企业的合法权益。如有具体法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。