是的，农村盖房子时，房主通常希望与施工队签订质量保证协议。这一做法在农村自建房领域中相当普遍，且具有重要的法律意义和实际价值。以下从多个角度对此进行分析：
一、法律层面
保障权益：签订质量保证协议是房主保障自身权益的重要手段。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是民事主体之间设立、变更、终止民事法律关系的协议。通过签订质量保证协议，房主可以明确施工队在房屋建设过程中的质量责任，确保房屋建设符合约定的质量标准。
明确责任：在协议中，可以详细规定施工队应承担的质量保证责任，包括但不限于使用合格材料、按照规范施工、提供一定期限的质量保修等。这样，一旦房屋出现质量问题，房主可以依据协议要求施工队承担相应的法律责任。
二、实际层面
预防纠纷：农村自建房过程中，由于施工队的专业水平、材料质量等因素，容易出现质量问题。签订质量保证协议可以在事前明确双方的权利和义务，预防因质量问题引发的纠纷。
提高质量：施工队在签订质量保证协议后，会更加注重施工过程中的质量控制，以确保房屋建设符合约定的质量标准。这有助于提高农村自建房的整体质量水平。
三、操作建议
明确条款：在签订质量保证协议时，房主应与施工队明确约定房屋建设的质量标准、材料要求、施工工艺、保修期限等关键条款。这些条款应具体、明确，具有可操作性。
保留证据：在协议签订和履行过程中，房主应保留好相关证据，如协议文本、付款凭证、施工照片等。这些证据在发生纠纷时将起到至关重要的作用。
及时维权：一旦发现房屋存在质量问题，房主应及时与施工队沟通协商，要求其承担相应的法律责任。如果协商无果，房主可以依据协议向法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
举例说明：假设某农村房主与施工队签订了一份质量保证协议，约定房屋建设应使用符合国家标准的建筑材料，并按照规范进行施工。在房屋建设过程中，房主发现施工队使用了劣质材料，且施工工艺存在严重问题。此时，房主可以依据协议要求施工队立即整改，并承担由此产生的额外费用。如果施工队拒绝整改或整改后仍不符合约定标准，房主可以依据协议向法院提起诉讼，要求施工队承担违约责任。
综上所述，农村盖房子时签订质量保证协议是明智之举。它不仅可以保障房主的合法权益，预防纠纷的发生，还可以提高房屋建设的整体质量水平。如果你在农村自建房过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。