结论：小额贷款公司起诉时，计算利息、逾期利息、违约金的总额，确实存在不超过年利率24%的法律规定，这一规定主要来源于《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》中关于利率上限的规定，并适用于小额贷款公司等金融机构的借贷纠纷。

法律背景与解释：

1. 利率上限的法律规定：

   • 根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》（虽名为“民间借贷”，但司法实践中，小额贷款公司等金融机构的借贷纠纷也参照此规定处理），借贷双方约定的利率未超过年利率24%，出借人请求借款人按照约定的利率支付利息的，人民法院应予支持。
   • 若借贷双方约定的利率超过年利率36%，则超过部分的利息约定无效。借款人请求出借人返还已支付的超过年利率36%部分的利息的，人民法院应予支持。
   • 对于年利率24%至36%之间的利息，法律并未明确禁止，但借款人已支付的，不得要求返还；未支付的，出借人请求支付的，人民法院不予支持。这一区间通常被称为“自然债务区”。

2. 利息、逾期利息、违约金的计算：

   • 在小额贷款公司的借贷合同中，通常会约定利息、逾期利息（即罚息）和违约金。这些费用的总额，在司法实践中，应受到年利率24%的上限限制。
   • 利息：是借款人因使用贷款而支付的费用，通常按日或按月计算。
   • 逾期利息：是借款人未按约定时间还款而需额外支付的费用，通常高于正常利息，以惩罚借款人的违约行为。
   • 违约金：是借款人违反合同约定（如提前还款、未按约定用途使用贷款等）而需支付的费用。
   • 在计算这些费用时，应确保它们的总额不超过年利率24%，否则，超出部分可能不会被法院支持。

3. 司法实践中的应用：

   • 在小额贷款公司起诉借款人的案件中，法院会审查借贷合同中的利息、逾期利息、违约金条款，确保它们的总额不超过年利率24%。
   • 如果借款人提出抗辩，认为这些费用的总额过高，法院会根据法律规定和案件事实进行裁决。
   • 在某些情况下，即使合同中约定了较高的利息、逾期利息或违约金，法院也可能根据公平原则和诚实信用原则，对超出年利率24%的部分进行调整或不予支持。

法律建议：

• 对于小额贷款公司而言，在制定借贷合同时，应合理设置利息、逾期利息和违约金的条款，确保它们的总额不超过年利率24%，以避免法律风险和纠纷。
• 对于借款人而言，在签订借贷合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于利息、逾期利息和违约金的约定，确保自己能够承担这些费用，并在必要时寻求法律帮助。
• 如果双方因利息、逾期利息或违约金的计算产生纠纷，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并寻求合法的解决途径。

示例计算：

假设借款人从小额贷款公司借款10万元，年利率为24%，借款期限为1年。

• 正常利息：10万元 * 24% = 2.4万元（一年）
• 若借款人逾期还款，假设逾期利息也为年利率24%（实际中可能更高，但受上限限制），则逾期期间的利息也按此计算。
• 若合同中还约定了违约金，如借款金额的5%，则违约金为0.5万元。
• 在此情况下，利息、逾期利息（假设与正常利息相同）和违约金的总额为2.4万元（正常利息）+ 0.5万元（违约金）= 2.9万元（假设无额外逾期利息），未超过以借款本金为基数、年利率24%计算的总额（即2.4万元的正常利息加上可能的合理逾期利息，但总额仍受24%限制），因此是合法的。若违约金或其他费用使得总额超过24%，则超出部分可能不被支持。