企业变更申请被驳回后并没有法律明确规定具体的驳回次数限制后不能再申请，但若多次被驳回，需根据不同情况采取相应措施，以下为你详细分析：

针对驳回原因进行整改

1. 仔细研究驳回通知 企业变更申请被驳回时，市场监管部门通常会出具驳回通知书，上面会详细说明驳回的具体原因。比如，如果是变更经营范围，可能因为新经营范围涉及前置许可项目，但企业未取得相应的许可证；如果是变更法定代表人，可能因为提交的法定代表人身份证明文件不完整或不符合要求。企业要认真研读驳回通知，明确问题所在。
2. 针对性整改 根据驳回原因，企业要迅速组织相关人员进行整改。例如，若因材料缺失被驳回，就及时补充完整所需材料；若因不符合相关政策法规被驳回，就调整变更方案，使其符合规定。以企业变更注册资本为例，如果是因为未按照规定进行验资程序而被驳回，企业就应委托合法的会计师事务所进行验资，并出具验资报告，然后再重新提交变更申请。

与市场监管部门沟通

1. 主动联系沟通 在完成整改后，企业可以主动与作出驳回决定的市场监管部门进行沟通。可以通过电话、邮件或者前往办事窗口等方式，向工作人员说明企业已经对驳回原因进行了整改，并询问整改后的申请是否符合要求。例如，企业变更地址被驳回，整改后重新准备材料，此时可以与工作人员沟通新地址是否符合区域规划等相关要求。
2. 了解审核标准和流程 在沟通的过程中，企业还可以进一步了解市场监管部门对企业变更申请的审核标准和流程。这有助于企业在后续的申请中更加准确地准备材料，避免再次出现因不了解规则而被驳回的情况。比如，了解审核过程中对材料真实性的核查方式、对变更事项合理性的判断标准等。

寻求法律帮助（如有必要）

1. 复杂情况分析 如果企业变更事项较为复杂，或者对驳回原因存在争议，企业可以寻求专业律师的帮助。律师可以从法律角度对驳回原因进行分析，判断市场监管部门的驳回决定是否合法合规。例如，在企业变更股权结构时，涉及到股东权益分配、公司章程修改等复杂的法律问题，如果被驳回且企业认为不合理，律师可以深入研究相关法律法规，为企业提供专业的法律意见。
2. 协助申请与维权 律师可以协助企业重新准备变更申请材料，确保材料的合法性和完整性。如果企业认为市场监管部门的驳回决定侵犯了企业的合法权益，律师还可以代表企业通过行政复议或者行政诉讼等法律途径进行维权。比如，企业认为市场监管部门在审核过程中存在程序违法或者适用法律错误的情况，律师可以帮助企业撰写行政复议申请书或者行政起诉状，维护企业的合法权益。