在男方要求做亲子鉴定而女方拒绝的情况下，法院的判决会依据具体情况和法律规定来综合考量，无法直接给出一个确定的判决结果，但可以分情况讨论：
若男方有充分证据证明亲子关系存在疑点：
- 根据《民法典》及相关司法解释，虽然亲子鉴定需要双方自愿，但如果男方能够提供必要的证据证明亲子关系可能存在问题（如血型不符、存在婚外情等合理怀疑的情形），且女方无正当理由拒绝配合进行亲子鉴定，法院在审理案件时，可能会倾向于支持男方的诉求，即推定男方与子女之间不存在亲子关系，或者根据其他证据来综合判断亲子关系。这种情况下，法院的判决可能会对女方不利。
若男方无法提供充分证据：
- 如果男方仅凭怀疑或没有足够证据支持其亲子关系存在疑点的主张，而女方坚决拒绝进行亲子鉴定，法院在审理时可能会更加谨慎。因为亲子鉴定涉及个人隐私和身份关系，不能仅凭一方的主观怀疑就强制进行。在这种情况下，法院可能会认为男方没有完成其举证责任，从而不支持其关于亲子鉴定的诉求，判决结果可能不会对女方产生不利影响。
特殊情况下的法院裁量：
- 法院在审理此类案件时，还会考虑子女的利益和福祉。如果进行亲子鉴定对子女的身心健康可能产生不良影响，或者子女已经达到一定年龄、具备了一定的认知能力，且明确表示反对进行亲子鉴定，法院可能会从保护子女利益的角度出发，拒绝男方的亲子鉴定请求。
法律建议：
- 对于男方而言，如果怀疑子女非亲生，应当积极收集相关证据，如血型报告、婚外情证据等，以支持其主张。同时，也应考虑与女方进行沟通协商，寻求和平解决的方式。
- 对于女方而言，如果拒绝进行亲子鉴定，应当有合理的理由和依据。如果担心亲子鉴定对子女或自身造成不良影响，可以向法院说明情况，并提供相关证据支持自己的主张。
- 无论男方还是女方，在涉及亲子鉴定的案件中，都应当尊重法院的判决和裁量权，遵守法律程序和规定。
可能后果：
- 如果法院支持男方的亲子鉴定诉求，而鉴定结果证明子女非亲生，这将对女方的名誉、家庭关系以及可能的财产分割等产生深远影响。
- 如果法院不支持男方的诉求，或者鉴定结果证明子女是亲生的，那么男方可能需要承担因此产生的法律责任和后果，如赔偿女方因此遭受的损失等。
总之，在处理此类案件时，法院会综合考虑各种因素来做出判决。如果你面临类似的问题或有其他法律疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。