拍卖公司收取房屋溢价部分是否合法，需视具体情况及拍卖合同约定而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、合法情形
合同明确约定：
- 如果拍卖合同中明确约定了拍卖公司有权收取房屋溢价部分作为佣金或服务费，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么拍卖公司收取溢价部分是合法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人有权在合同中约定各自的权利和义务，只要该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，即具有法律效力。
行业惯例或市场规则：
- 在某些特定的拍卖市场或行业中，可能存在收取房屋溢价部分作为佣金的惯例或规则。如果这种惯例或规则在行业内被广泛接受，且不违反法律法规，那么拍卖公司按照惯例或规则收取溢价部分也是合法的。
二、不合法情形
合同未约定或约定不明：
- 如果拍卖合同中没有明确约定拍卖公司有权收取房屋溢价部分，或者约定不明确，那么拍卖公司擅自收取溢价部分可能构成违约或不当得利，是不合法的。
- 法律后果：在这种情况下，拍卖公司可能需要退还收取的溢价部分，并可能承担违约责任或赔偿损失。
违反法律法规的强制性规定：
- 如果拍卖公司收取房屋溢价部分的行为违反了法律法规的强制性规定，如《中华人民共和国拍卖法》中关于佣金收取的规定，那么该行为是不合法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国拍卖法》第五十六条：“委托人、买受人可以与拍卖人约定佣金的比例。委托人、买受人与拍卖人对佣金比例未有约定，拍卖成交的，拍卖人可以向委托人、买受人各收取不超过拍卖成交价百分之五的佣金。收取佣金的比例按照同拍卖成交价成反比的原则确定。拍卖未成交的，拍卖人可以向委托人收取约定的费用；未作约定的，可以向委托人收取为拍卖支出的合理费用。” 如果拍卖公司收取的溢价部分超出了法定佣金比例或未按照约定收取，则可能构成违法。
三、建议与注意事项
仔细审查拍卖合同：
- 在参与拍卖前，务必仔细审查拍卖合同中的条款，特别是关于佣金或服务费的约定。确保自己清楚了解拍卖公司的收费标准和方式。
了解行业惯例和市场规则：
- 在参与拍卖前，可以了解所在行业或市场的惯例和规则，以便更好地判断拍卖公司的收费是否合理。
保留相关证据：
- 在参与拍卖过程中，务必保留好所有与拍卖相关的证据，如拍卖合同、成交确认书、付款凭证等。以便在发生纠纷时能够证明自己的权益。
及时咨询专业律师：
- 如果对拍卖公司的收费行为存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师，以便得到专业的法律意见和帮助。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供更详细、更专业的法律建议。