摩托车行车证过期两年以上，一般会面临罚款、扣车等处罚，具体处罚措施可能因地区而异，但通常包括以下方面：
罚款：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，驾驶未按照规定期限进行安全技术检验的机动车上道路行驶的，公安机关交通管理部门通常会处以罚款。罚款的具体数额可能因地区和具体情节而有所不同，但一般来说，对于过期两年以上的情况，罚款可能会相对较高。
扣车：
- 公安机关交通管理部门在发现摩托车行车证过期后，有权扣留机动车，直至车主办理完相关手续并取得有效的行车证。这意味着，如果您的摩托车行车证过期两年以上，您的车辆可能会被扣留，直到您补办行车证并缴纳相关罚款。
其他可能的影响：
- 除了罚款和扣车外，摩托车行车证过期还可能影响您的车辆保险、年检等后续事宜。例如，保险公司可能会因为车辆行车证过期而拒绝赔付或提高保费；同时，过期未年检的车辆在后续年检时可能会面临更严格的审查或额外的费用。
针对您的情况，我建议您：
- 尽快前往当地车辆管理所或交通管理部门咨询并补办摩托车行车证。在补办过程中，您可能需要提供车辆的相关资料、缴纳罚款并接受可能的车辆检查。
- 在补办行车证的同时，也检查一下您的车辆保险是否有效，并考虑进行必要的年检或维修，以确保车辆符合上路标准。
- 今后务必注意行车证的有效期，提前办理续期手续，避免类似情况再次发生。
如果您在补办行车证或处理相关事宜过程中遇到任何法律问题或困惑，欢迎随时向我咨询。我会根据您的具体情况提供详细的法律建议和帮助。