单位内部房产证是否合法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 若单位内部房产证是基于合法程序和规定办理的：

   • 在一些特定情况下，如单位自有的土地上建设的房屋，或者单位通过合法途径（如购买、划拨等）获得的土地上建设的房屋，且按照相关法律法规和程序办理了房产证，那么这样的房产证是合法的。它代表了单位对该房屋的合法所有权或使用权，受法律保护。

2. 若单位内部房产证存在违法情形：

   • 未经批准或违反规划建设：如果单位在未经相关部门批准或违反城市规划的情况下建设房屋，并试图办理房产证，那么这样的房产证是不合法的。因为房屋本身的建设就违反了法律法规，房产证自然也无法获得法律认可。
   • 土地性质不符：如果单位所占用的土地性质不符合建设房屋的要求（如宅基地用于非农业建设），或者单位未按照规定的土地用途使用土地，那么在此基础上办理的房产证也是不合法的。
   • 办理程序违法：在办理房产证的过程中，如果存在伪造文件、贿赂等违法行为，或者未按照规定的程序进行办理，那么这样的房产证同样是不合法的。

法律后果与建议：

• 对于不合法的单位内部房产证：一旦被发现，可能会面临被撤销、罚款等行政处罚，甚至可能涉及刑事责任。同时，该房屋也可能无法进行合法的交易、抵押等处置。
• 建议：如果您对单位内部房产证的合法性存在疑问，或者正在面临相关纠纷，建议您及时咨询专业律师（当然，您可以直接向我咨询，我专注于合同纠纷、房产纠纷领域）。律师会根据您的具体情况，结合相关法律法规和案例，为您提供专业的法律意见和解决方案。

额外提醒：

• 在处理房产纠纷时，证据的收集和保存至关重要。因此，如果您涉及相关纠纷，请务必保留好所有与房产证办理、房屋建设、土地使用等相关的文件和资料。
• 房产纠纷往往涉及复杂的法律关系和利益纠葛，因此建议您在处理时保持冷静和理性，避免采取过激或违法的行为。

希望以上分析能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。