个税证明并不能直接证明劳动关系的存在。虽然用人单位作为个税的扣缴义务人，会按照国家规定给员工办理扣缴申报个税，但这并不意味着只要申报了个税，双方就一定存在劳动关系。
在确认劳动关系时，我们需要综合考虑多个因素，而不能仅凭个税申报记录这一单一证据。具体来说，我们可以从以下几个方面来评判双方是否存在劳动关系：
双方主体资格：用人单位和劳动者是否具备法律规定的主体资格，这是确认劳动关系的基础。
劳动规章制度：用人单位的各项劳动规章制度是否适用于劳动者，劳动者是否需要遵守这些规章制度。
劳动管理：劳动者是否受用人单位的劳动管理，比如是否需要按照用人单位的安排进行工作，是否需要接受用人单位的考核等。
有报酬的劳动：劳动者是否在从事用人单位安排的有报酬的劳动，这是劳动关系的重要特征之一。
业务组成部分：劳动者提供的劳动是否是用人单位业务的组成部分，这也是判断劳动关系是否存在的重要因素。
以您提供的案例为例，虽然小张提供了A公司为其申报个税的记录，但仲裁庭在综合考虑了其他因素后，认为小张从事的项目现场监理管理工作并非A公司业务组成，且报酬是由李老板个人微信支付，并非A公司支付。因此，仲裁庭认为双方不存在劳动关系。
所以，个税证明只是确认劳动关系的一个参考因素，而不能作为决定性的证据。在发生争议时，我们需要根据“谁主张谁举证”的原则，注重证据的收集，以形成完整的证据链，从而维护自身的合法权益。如果您在确认劳动关系方面遇到问题，建议咨询专业的法律人士或劳动仲裁机构，以获取更准确的法律意见和帮助。