针对您提出的“水井算土地纠纷怎么处理”的问题，这实际上涉及到土地权属争议的处理。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，水井作为土地上的一种设施，其权属通常与土地权属紧密相连。因此，处理水井相关的土地纠纷，本质上就是处理土地权属争议。

一、处理原则

根据《土地管理法》及相关规定，土地权属争议应遵循以下原则处理：

1. 协商解决：当事人应首先尝试通过协商解决争议，这是最直接、最经济的方式。
2. 人民政府处理：协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。
3. 司法救济：当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。

二、处理程序

1. 申请调查处理：

   • 申请人应与争议土地有直接利害关系，有明确的请求处理对象、具体的处理请求和事实依据。
   • 向争议土地所在地的县级国土资源行政主管部门（或根据申请由乡级人民政府）提出申请。

2. 调查与调解：

   • 县级以上国土资源行政主管部门负责土地权属争议案件的调查和调解工作。
   • 调查过程中，双方当事人需对各自提出的事实和理由负有举证责任。

3. 处理决定：

   • 对需要依法作出处理决定的，县级以上国土资源行政主管部门拟定处理意见，报同级人民政府作出处理决定。
   • 处理决定应明确土地权属归属，并告知当事人相关的权利和义务。

4. 执行与监督：

   • 当事人应执行人民政府的处理决定。
   • 如对处理决定不服，可依法向人民法院起诉。

三、特殊情况处理

• 如果水井涉及跨行政区域的土地权属争议，应由上一级人民政府或相应的国土资源行政主管部门处理。
• 如果争议一方为中央国家机关直属单位、军队或涉及较大土地面积，可能需要由更高层级的国土资源行政主管部门或人民政府处理。

四、建议

• 在处理水井相关的土地纠纷时，建议当事人保留好相关证据，如土地使用证、水井建设合同、照片等，以便在协商或诉讼过程中证明自己的权益。
• 如果争议复杂或涉及金额较大，建议咨询专业律师或法律机构，以获取更专业的法律建议和支持。

综上所述，处理水井相关的土地纠纷需要遵循土地权属争议的处理原则和程序。希望以上解答能对您有所帮助。如有其他疑问或需要进一步的法律支持，请随时咨询。