结论前置：法定代表人不是股东的情况下进行变更，主要需遵循公司章程和相关法律法规，通过内部决策、准备相关材料、办理工商登记变更等步骤完成。以下是详细解答：

一、法定代表人变更的基本流程

1. 内部决策

   • 召开股东会或董事会：根据公司章程的规定，召开股东会或董事会，形成变更法定代表人的决议。决议需明确新法定代表人的姓名等信息，并通常需要三分之二以上表决权的股东同意（具体比例根据公司章程确定）。
   • 形成书面决议：决议应由参会股东或董事签字确认，并形成书面文件，作为后续变更登记的依据。

2. 准备材料

   • 《公司登记（备案）申请书》：由现任法定代表人签署，用于向公司登记机关申请变更登记。
   • 股东会或董事会决议：关于变更法定代表人的决议原件，证明变更的合法性和内部决策程序。
   • 新法定代表人的身份证件复印件：用于确认新法定代表人的身份。
   • 免职和任职文件：根据公司章程要求，准备原法定代表人的免职文件和新法定代表人的任职文件。

3. 工商登记变更

   • 提交材料：携带上述材料至公司登记机关（通常是市场监督管理局）办理变更登记。
   • 审核与变更：材料齐全且符合法定形式的，登记机关将受理并进行变更登记，更新公司登记信息。

4. 领取新营业执照

   • 完成变更：变更登记完成后，按照登记机关规定的时间领取新的营业执照，标志着法定代表人变更的正式完成。

5. 其他变更

   • 税务变更：携带新营业执照等材料至主管税务机关，更新税务登记信息。
   • 银行信息变更：携带新营业执照、法人身份证等至开户银行，更新银行账户信息。

二、特殊情况处理

• 原法定代表人不配合变更：如果原法定代表人不配合变更，公司可以依据法律和章程规定，通过股东会或董事会决议罢免其职务，并选举新法定代表人。之后，按照上述流程办理变更登记。
• 确保合法合规：在整个变更过程中，应确保所有操作均合法合规，避免法律纠纷。特别是要确保内部决策程序的合法性和决议的有效性。

三、法律背景与建议

• 法律依据：根据《中华人民共和国公司法》第十三条的规定，公司法定代表人由董事长、执行董事或者经理担任，并依法登记。这表明法定代表人的选任并不局限于股东身份，而是侧重于管理能力和职位要求。
• 建议：
  • 提前规划：在变更法定代表人前，应提前规划并了解相关法律法规和公司章程的要求，确保变更的合法性和顺利进行。
  • 咨询专业人士：虽然我可以提供法律咨询，但在实际操作中，如果涉及复杂情况或不确定之处，建议咨询具有丰富经验的律师或法律顾问，以确保变更的合法性和有效性。
  • 保持沟通：在变更过程中，应与公司内部相关人员（如股东、董事、监事等）保持沟通，确保变更得到他们的理解和支持。

四、可能涉及的法律后果

• 如果变更程序不合法或存在瑕疵：可能导致变更登记被撤销或无效，甚至可能引发法律纠纷和行政处罚。
• 如果新法定代表人存在违法或违规行为：公司可能需要承担相应的法律责任。因此，在选任新法定代表人时，应谨慎审查其背景和资质。

法定代表人不是股东的情况下进行变更，需要遵循一定的法律程序和内部决策流程。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。