结论：关于欠了工商（这里假设您指的是“工伤保险基金”或相关工伤保险赔偿机构，但通常表述为“工伤保险待遇未支付”或“欠缴工伤保险费”等，不过为解答问题，我们按“欠付工伤保险相关款项”理解）3000元，5年后是否可以只还本金的问题，这并非一个简单的“可以”或“不可以”的答案，而是需要根据具体情况来判断。
分析角度一：欠款性质与合同约定
如果欠款是工伤保险待遇的未支付部分：
- 工伤保险待遇的支付通常有明确的法律规定和标准，包括医疗费用、伤残津贴、一次性伤残补助金等。
- 如果是因为单位未依法缴纳工伤保险费导致您未能及时获得工伤保险待遇，那么单位除了需要支付您应得的工伤保险待遇外，还可能面临行政处罚。
- 在这种情况下，您要求只还本金（即仅要求支付工伤保险待遇的未支付部分，而不要求其他赔偿或利息）可能是合理的，但具体还需看您与单位之间的协商结果以及相关法律法规的规定。不过，通常工伤保险待遇的支付不涉及“利息”问题，而是关注待遇的及时性和足额性。
如果欠款是工伤保险费的欠缴：
- 单位欠缴工伤保险费是违法行为，需要承担补缴、滞纳金等法律责任。
- 在这种情况下，您作为劳动者（如果涉及个人部分欠缴，但通常工伤保险费由单位承担）或相关机构（如工伤保险基金管理机构）要求单位补缴欠缴的工伤保险费是合理的。
- 关于是否可以只还本金而不支付滞纳金或其他费用，这通常取决于相关法律法规的规定以及单位与工伤保险基金管理机构之间的协商结果。一般来说，滞纳金是法定责任，难以免除。
分析角度二：时间因素与诉讼时效
- 无论欠款性质如何，时间因素（5年）都可能影响您的权益主张。
- 如果欠款涉及民事纠纷（如单位与您之间的工伤保险待遇支付纠纷），您需要注意诉讼时效的问题。根据《中华人民共和国民法典》的规定，一般民事纠纷的诉讼时效为三年（特殊情况除外）。如果超过诉讼时效，您可能面临败诉的风险。
- 然而，如果欠款涉及行政责任（如单位欠缴工伤保险费的行政处罚），则通常不受诉讼时效的限制。
建议：
- 明确欠款性质：首先，您需要明确这笔欠款的性质是工伤保险待遇的未支付部分还是工伤保险费的欠缴。
- 查阅相关法律法规：根据欠款性质，查阅相关的法律法规，了解您的权利和单位的义务。
- 与单位协商：在明确权利和义务的基础上，与单位进行协商，尝试达成和解协议。
- 寻求法律援助：如果协商无果，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师（即向我咨询），以维护您的合法权益。
最后，需要强调的是，每个案件的具体情况都是独特的，因此上述分析仅供参考。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。