在知识产权诉讼中，被告若确实在不知情的情况下被指控侵权，可以通过以下方式维护自身权益：

1. 立即停止涉嫌侵权行为
   无论是否知情，被告应第一时间停止生产、销售、宣传等可能涉及侵权的行为。这是避免损失扩大的关键步骤，也是后续抗辩的重要前提。若能证明已及时停止，法院可能酌情减轻赔偿责任。

2. 收集“不知情”的证据
   被告需证明自身无主观过错（即“善意侵权”），可重点收集以下证据：

   • 合法来源证明：如采购合同、发票、付款记录等，证明商品或技术来源于合法渠道；
     
   • 尽职调查记录：如对供应商资质、知识产权状况的核查记录；
     
   • 行业惯例证据：证明自身行为符合行业常规操作，无故意规避法律之嫌。
     这些证据可能帮助被告免除或减轻赔偿责任（根据《商标法》第64条、《专利法》第77条等规定）。

3. 主张“合理使用”或“先用权”等抗辩事由

   • 若被告行为符合《著作权法》中的“合理使用”（如个人学习、评论、新闻报道等）或《专利法》中的“先用权”（在专利申请日前已制造相同产品、使用相同方法），可据此抗辩；
     
   • 若被诉商标侵权，可主张商标未实际使用（如原告未连续三年使用商标），从而避免赔偿（根据《商标法》第64条）。

4. 申请法院责令原告提供侵权证据
   若原告仅提供初步证据，被告可依据《民事诉讼法》及司法解释，申请法院责令原告提交完整证据（如技术比对报告、销售数据等），以还原事实真相。

5. 反诉原告滥用权利
   若原告存在恶意诉讼、虚假陈述等行为，被告可提起反诉，要求原告赔偿因诉讼造成的损失（如律师费、商誉损失等）。

6. 积极协商和解
   在诉讼过程中，被告可主动与原告沟通，提出合理赔偿方案（如支付少量许可费）或承诺改进措施，争取达成和解，降低诉讼成本。

温馨提示：知识产权诉讼专业性强，证据规则复杂，建议被告在收到起诉状后立即委托律师介入，制定针对性策略。若您有具体案件细节，可直接向我咨询，我将结合案情提供进一步分析。