综合工时制下的加班费规定可以总结为以下几点：
一、综合工时制的定义与适用条件
综合工时制，即综合计算工时工作制，是针对特定行业和工作性质的职工，采用以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的一种特殊工时制度。它主要适用于交通、铁路、邮电、水运、航空、渔业等行业中因工作性质特殊需连续作业的职工，以及地质及资源勘探、建筑、制盐、制糖、旅游等受季节和自然条件限制的行业的部分职工。企业实行综合计算工时工作制，必须经过劳动行政部门的审批。
二、加班认定及加班费支付标准
加班认定：
- 在综合计算周期内，如果劳动者的实际工作时间总数超过该周期的法定标准工作时间总数，超出部分视为延长工作时间，即加班。
加班费支付标准：
- 延长工作时间：按照不低于劳动者本人小时工资标准的150%支付加班工资。
- 休息日加班且不能补休：在综合工时制下，虽然无固定休息日，但若用人单位在员工的休息日安排了工作且不能安排补休，则需按照不低于劳动者本人日或小时工资标准的200%支付加班工资。
- 法定节假日加班：无论综合计算周期内的工作时间是否超过法定标准工作时间，用人单位安排劳动者在法定节假日工作的，都需按照不低于劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班工资。
三、具体计算方式与示例
以月度综合工时制为例，假设员工月薪为5000元，当月法定标准工作时间为167小时（按每月约21.75个工作日，每日8小时计算），员工当月实际工作200小时，其中包含法定节假日工作8小时。
- 标准工时：167小时/月
- 超时工时：200 - 167 = 33小时
- 法定节假日加班费：
- 日工资 = 5000元 ÷ 21.75 ≈ 229.89元/天
- 法定节假日加班费 = 229.89元 × 300% × (8小时 ÷ 8小时) = 689.67元
- 延时加班费（假设剩余33小时均为延时）：
- 小时工资 = 5000元 ÷ (21.75 × 8) ≈ 28.74元/小时
- 延时加班费 = 28.74元 × 150% × 33小时 ≈ 1422.63元
- 总加班费：689.67元 + 1422.63元 = 2112.30元
四、关键注意事项
- 审批合规性：企业需经劳动部门批准后实施综合工时制，未经审批的按标准工时计算加班费。
- 周期清零原则：每个计算周期结束后，工时重新累计，上月超时不累计至本月。
- 法定假日特殊性：即使周期内总工时未超标，法定假日工作仍需支付300%加班费。
- 证据留存：企业应保存考勤记录、排班表等，以备劳动争议时作为证据。
五、实操建议
- 企业端：确保综合工时制方案通过审批并公示，与员工签订书面协议；建立电子考勤系统精确记录工时；定期核算周期内工时，及时支付加班费。
- 员工端：保存考勤记录，了解自身权益；发现异常及时与企业沟通或向劳动监察部门投诉。
总结：综合工时制下的加班费规定既体现了灵活性，也确保了劳动者的合法权益。企业在实施时，应严格遵守相关法律法规，确保加班费的正确计算和支付。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。