微信协商赔偿后，原有合同是否还有效，需分情况讨论：

1. 若微信协商赔偿构成对原合同的变更：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人协商一致，可以变更合同。微信作为即时通讯工具，其聊天记录在符合一定条件下（如能够证明双方身份、意思表示真实等）可以作为证据使用，证明双方对原合同进行了变更。
   • 具体分析：如果双方在微信中明确表达了变更原合同赔偿条款的意思，且该变更不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该变更即具有法律效力。在此情况下，原有合同中关于赔偿的条款被新协商的赔偿条款所替代，但合同的其他部分（如履行期限、履行方式等）若未被变更，则仍然有效。
   • 法律后果：双方应按照新协商的赔偿条款履行义务，若一方违反，另一方有权要求其承担违约责任。

2. 若微信协商赔偿不构成对原合同的变更，而是作为额外赔偿或和解协议：

   • 法律背景：同样根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以就合同履行过程中的争议达成和解协议。和解协议是双方对争议事项的重新约定，不影响原合同的效力。
   • 具体分析：如果双方在微信中协商的赔偿并非是对原合同赔偿条款的变更，而是作为对原合同履行过程中产生的争议的额外赔偿或和解方案，那么该协商结果并不影响原合同的效力。原合同仍然有效，双方应继续按照原合同的约定履行义务。同时，双方也应按照微信协商的赔偿结果履行相应的支付或接受赔偿的义务。
   • 法律后果：若一方违反原合同或微信协商的赔偿结果，另一方有权要求其承担相应的违约责任或赔偿责任。

3. 若微信协商赔偿存在瑕疵或无效情形：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同或协议的成立和生效需满足一定条件，如双方意思表示真实、不违反法律行政法规的强制性规定等。若微信协商赔偿存在欺诈、胁迫、重大误解等情形，或违反法律、行政法规的强制性规定，则该协商结果可能无效或可撤销。
   • 具体分析：如果双方在微信中协商赔偿时存在上述瑕疵或无效情形，那么该协商结果可能无法产生法律效力。在此情况下，原有合同的效力不受影响，双方仍应按照原合同的约定履行义务。若因协商赔偿的瑕疵或无效导致一方遭受损失，受损方有权要求对方承担赔偿责任。
   • 法律后果：受损方可以向法院提起诉讼或申请仲裁，要求确认微信协商赔偿的无效或撤销，并要求对方承担相应的赔偿责任。

建议：

• 在微信协商赔偿时，建议双方明确表达变更原合同或作为额外赔偿的意思，并保留好聊天记录作为证据。
• 若对微信协商赔偿的效力存在疑虑，建议咨询专业律师进行法律分析，以确保自身权益得到保障。
• 在履行合同或协商赔偿过程中，双方应遵守诚实信用原则，按照约定履行义务，避免产生不必要的争议和损失。

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