当月休了年假应当算全勤，且公司不应因此扣减员工的全勤奖或影响其他福利待遇。以下是从不同角度的详细分析：

法律依据与年休假性质

1. 《职工带薪年休假条例》第二条：明确规定，连续工作1年以上的职工享受带薪年休假，这是法律赋予劳动者的法定权利。在年休假期间，劳动者享受与正常工作期间相同的工资收入，意味着休年假属于劳动者的正常出勤，用人单位应支付全额工资。

2. 《企业职工带薪年休假实施办法》第六条：也强调，职工依法享受的年休假不计入其他假期，其性质与法定节假日相似，均属于带薪休息。这进一步支持了休年假期间应视为正常出勤的观点。

全勤的定义与年休假的关系

全勤通常指员工在一个考勤周期内，按照用人单位的正常工作制度，未出现迟到、早退、旷工、请假（除法定的带薪假期外）等缺勤情况。年休假作为劳动者的法定带薪假期，员工休年休假是合法行使自己的权利，并非无故缺勤或违反公司考勤制度。因此，从逻辑上讲，休年假并不违反全勤的定义，也不应被视为缺勤行为。

公司规章制度的影响与合法性判断

尽管法律规定了年休假的性质和待遇，但具体是否扣除全勤还需参考公司的规章制度。不过，公司规章制度中关于年休假与全勤的规定，必须满足以下条件才具有法律效力：

1. 经过合法程序制定：如经过民主程序讨论、公示或告知劳动者。
2. 内容不违反法律法规的强制性规定：即不能违背《劳动法》、《职工带薪年休假条例》等相关法律法规。
3. 合理性考量：若规章制度明显不合理，损害了劳动者的合法权益，即使经过合法程序制定，也可能被认定为无效。

实践中，若公司规章制度规定休年假影响全勤，且该规定未经过合法程序制定或内容违反法律法规，那么该规定对劳动者不具有约束力。劳动者有权要求公司按照全勤标准支付相应的全勤奖或其他福利待遇。

特殊情况考虑

若员工在休年假的同时存在其他缺勤情况（如病假、事假等），这些缺勤可能会影响到全勤保底工资的发放。但这与仅因休年假而被扣减全勤奖的情况不同。公司应合理区分员工的不同缺勤类型，并依据合法有效的规章制度进行考勤管理和奖金发放。

综合建议

1. 查看公司规定：首先，员工应查阅公司关于全勤和年假的具体规定，确保自身权益不受侵害。
2. 沟通协商：若公司规定与法律法规相悖，员工可与公司进行沟通协商，要求修正不合理规定。
3. 法律维权：在必要时，员工可通过劳动仲裁等法律途径维护自身合法权益，确保休年假不影响全勤认定及相应福利待遇的发放。

总结来说，当月休了年假应当被认定为全勤，且公司应按照全勤标准支付相应的全勤奖或其他福利待遇。这是符合法律法规和公平原则的。若公司存在不合理规定或行为，员工应积极维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。