结论：高空作业证挂靠在公司后，原则上不允许他人使用，否则可能涉及多重法律风险。

1. 从证件使用合法性角度
   高空作业证是特种作业操作证的一种，根据《特种作业人员安全技术培训考核管理规定》，特种作业人员必须持证上岗，且证件需与实际作业人员一致。若将证件挂靠在公司后由他人使用，属于“人证分离”的违法行为，可能面临行政处罚（如罚款、吊销证件），甚至在发生安全事故时被追究刑事责任。

2. 从挂靠协议效力角度
   即使您与公司签订了挂靠协议，约定“证件由公司使用”，此类协议因违反法律强制性规定（如《安全生产法》中关于特种作业人员资质的要求）而无效。一旦发生纠纷，您无法通过协议免除法律责任，反而可能因协助违法行为被追责。

3. 从公司责任角度
   若公司使用您的证件进行高空作业，但实际作业人员无证或操作不当导致事故，公司需承担主要赔偿责任。但作为证件持有人，您可能因“纵容违法行为”被认定为共同侵权人，需承担连带赔偿责任（如医疗费、赔偿金等）。

4. 从个人风险角度

   • 行政风险：应急管理部门检查时发现“人证分离”，可能直接吊销您的证件，并纳入特种作业人员诚信记录。
     
   • 刑事风险：若因他人使用您的证件导致重大安全事故（如死亡、重伤），您可能因“重大责任事故罪”被追究刑事责任（即使您未直接参与作业）。
     
   • 信用风险：挂靠行为可能影响个人征信，未来在就业、贷款等方面受限。

建议：

• 立即终止挂靠行为，要求公司归还证件；
  
• 若公司拒绝，可向当地应急管理部门举报（匿名或实名）；
  
• 定期查询证件状态，确保未被非法使用；
  
• 如已因此产生纠纷，可进一步向我咨询具体维权方案。
  

高空作业证关乎生命安全，切勿因短期利益触碰法律红线。如有其他疑问，欢迎随时向我提问。