工程超期罚款上限需根据具体合同约定及法律规定综合判断，通常无绝对法定上限，但需符合以下原则：

1. 合同约定优先
   若施工合同中明确约定了超期罚款的计算方式（如按日计罚、固定比例罚款等）及上限条款，且该条款不违反法律强制性规定（如显失公平、恶意串通等），则以合同约定为准。例如：合同约定“逾期竣工每日按合同总价的0.1%罚款，上限不超过合同总价的10%”，此类条款通常有效。

2. 法定限制情形

   • 违约金过高调整规则：根据《民法典》第585条，若约定的罚款（违约金）显著高于实际损失（如逾期导致发包方额外支付的租赁费、利息等），违约方可请求法院或仲裁机构予以调减。司法实践中，通常以实际损失的130%为参考标准。
     
   • 行政处罚上限：若工程超期涉及行政许可（如施工许可证逾期），行政机关可能依据《建筑法》《行政处罚法》等规定处罚，但此类罚款针对的是违法违规行为，与民事合同中的罚款性质不同。

3. 实际损失填补原则
   即使合同未约定上限，罚款金额也不应超过违约方违约行为给对方造成的实际损失。例如：若逾期竣工导致发包方仅产生10万元损失，即使合同约定罚款20万元，法院也可能将罚款调减至10万元。

建议：

• 签订合同时，明确罚款计算方式及合理上限（如参考工程利润的10%-20%），避免条款无效风险；
  
• 发生争议时，及时固定实际损失证据（如第三方鉴定报告、财务凭证等），为调整罚款金额提供依据；
  
• 若罚款金额过高，可主动与对方协商或通过法律途径申请调减。
  

如有具体合同条款或案例细节，可进一步向我咨询，我会结合实际情况为您分析。