关于工程合同中竣工延期罚款的上限，这并非由单一法律条文统一规定，而是需要综合考虑合同类型、项目性质、地区法规以及双方协商结果来综合确定。以下是对这一问题的详细解答：

一、法律法规框架下的原则性规定

1. 《中华人民共和国民法典》合同编：

   • 该法明确规定，当事人可以约定违约金或损失赔偿额的计算方法。如果约定的违约金低于实际损失，法院或仲裁机构可以根据请求增加；反之，如果违约金过分高于实际损失，则可以适当减少。这一条款为工程延期罚款提供了基本的法律依据，但具体数额需要根据实际情况进行调整。

2. 《建设工程施工合同（示范文本）》：

   • 作为行业指导性文件，它并未直接设定罚款上限。而是通过“通用合同条款”和“专用合同条款”的差异化设计，允许发承包双方在公平的基础上协商确定逾期竣工违约责任的具体形式与金额。例如，在专用条款中可以明确每日按合同价款的万分之几计收违约金。

二、实践中的常见计算方式

1. 固定比例罚款：

   • 按照合同总价的一定比例收取罚款，如0.5%-3%。这种方式简单直观，但需要确保比例设置合理，避免显失公平。

2. 日罚金制度：

   • 以延误天数乘以固定金额来计算罚款，如每日按合同价的0.01%-0.1%计收。需要注意的是，累计金额不得超过合理范围，以防止过度惩罚。

3. 分阶段递进式罚款：

   • 根据延误时长设置不同的处罚标准。例如，前10天按较低比例收费，之后逐步提高。这种机制既体现了警示作用，又兼顾了公平性。

三、影响罚款上限的关键因素

1. 项目特性：

   • 大型复杂项目的风险承受力较强，可能接受更高的罚款上限；而小型项目则更倾向于保守设置。

2. 地区差异：

   • 不同省市可能出台地方性规范来指导罚款标准。例如，某些地区规定政府投资项目的罚款不得超过合同价的5%。

3. 合同约定优先：

   • 只要不违反法律的强制性规定，双方可以在合同中自由约定罚款上限。例如，某商业综合体项目可能约定最高不超过合同总价的10%。

四、特殊情况处理

• 如果建筑工程合同中无约定逾期竣工的违约金，且因为承包人的原因造成逾期竣工，那么可以采取以下方法解决：
  1. 与承包人协商解决，包括交付时间、逾期交付的违约金、给发包人造成的损失等。
  2. 发包人对承包人造成的逾期竣工的违约行为可以主张解除合同。

五、风险提示

• 在进行工期索赔时，主要依据合同规定的总工期计划、进度计划，以及双方共同认可的对工期修改文件、调整计划和受干扰后实际工程进度记录（如施工日记、工程进度表等）。承包人应在每个月底以及在干扰事件发生时，分析对比上述资料，以发现工期拖延以及拖延原因，并提出有说服力的索赔要求。

综上所述，工程合同中竣工延期罚款的上限并非固定不变，而是需要根据具体情况进行综合考量。在签订合同时，双方应充分协商并明确约定相关条款，以避免后续纠纷。