合作分成协议在符合法律规定的情况下是合法的。以下从多个角度为你详细分析：

法律基础与基本原则

合作分成协议本质上是一种合同，其制定、执行及争议解决主要受《中华人民共和国民法典》（以下简称“《民法典》”）的规范。《民法典》合同编对合同的订立、履行、变更、终止等方面作出了全面规定，为合作分成协议提供了坚实的法律基础。根据《民法典》第一百四十三条，有效的民事法律行为需满足以下条件：

1. 行为人具有相应的民事行为能力：这意味着签订合作分成协议的双方或多方当事人必须具备签订合同的法律资格，如具有完全民事行为能力的自然人或依法成立的法人、其他组织。
2. 意思表示真实：协议内容必须是双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。
3. 不违反法律法规强制性规定且不违背公序良俗：合作分成协议的内容必须合法，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背社会公德和公共利益。

协议内容要求

合作分成协议应详细约定合作的目的、范围、期限、双方的权利和义务、分成比例、违约责任等条款。这些条款的约定应当明确、具体，避免模糊不清或存在歧义，以确保合同的合法性和有效性。例如，分成比例应明确约定是基于何种标准（如销售额、利润等）进行计算，以及支付的时间和方式等。

特定领域合作分成协议的法律规定

1. 技术合作：若合作分成协议涉及技术合作，可能还需遵循《民法典》中技术合同的相关规定，包括但不限于技术的转让、许可、保密及后续改进等方面的约定。例如，如果合作涉及专利技术的使用，还需考虑《专利法》的相关规定，确保技术的合法使用和保护。
2. 知识产权：若合作涉及知识产权，如商标、著作权等，还需考虑《商标法》《著作权法》等相关法律的规定。例如，在合作过程中使用他人的商标或著作权作品时，应确保已获得合法授权，并遵守相关使用规定。
3. 企业经营与合作：若合作分成协议涉及企业经营或合伙，还应参考《公司法》《合伙企业法》等相关法律。特别是关于合伙人出资、利润分配、亏损分担、决策机制及解散清算等方面的规定，以确保合作过程的合法性和规范性。

违约责任的承担

如果一方违反合作分成协议约定，对方可以依据《民法典》合同编中关于违约责任的相关规定，要求违约方承担继续履行、采取补救措施或赔偿损失等违约责任。例如，如果一方未按约定支付分成款项，另一方可以要求其支付欠款及逾期利息等。

实际操作建议

1. 签订书面协议：为了确保合作分成协议的合法性和有效性，建议双方签订书面协议，并明确约定各项条款。
2. 咨询专业律师：在签订合作分成协议前，可以咨询专业律师的意见，以确保协议内容符合法律规定，并避免潜在的法律风险。当然，如果你有任何法律问题，也可以直接向我咨询，我专注于医疗纠纷、合同纠纷领域，能够为你提供专业的法律建议。
3. 保留相关证据：在合作过程中，应保留好与协议履行相关的证据，如交易记录、支付凭证等，以便在发生纠纷时作为证据使用。

综上所述，合作分成协议在符合法律规定的情况下是合法的。为了确保协议的合法性和有效性，建议双方在签订协议前仔细审查协议内容，并咨询专业律师的意见。