检察院不起诉后，公安机关记录的犯罪嫌疑人信息通常不会自动消除，但可以通过法定程序申请处理。具体分析如下：

1. 不起诉决定不等于无犯罪记录
   检察院作出不起诉决定（包括法定不起诉、酌定不起诉、存疑不起诉），仅表明案件在刑事诉讼程序中终止，未进入审判阶段，不意味着行为人被认定为无罪或犯罪记录被消除。根据《刑事诉讼法》第12条，未经法院判决不得确定有罪，但不起诉决定本身不直接触发犯罪记录的清除。

2. 公安机关记录的性质与处理方式

   • 行政处罚记录：若案件涉及行政处罚（如拘留、罚款），相关记录会保存在公安机关的行政处罚档案中，需通过行政复议或诉讼撤销处罚决定后，方可申请消除记录。
     
   • 刑事案件记录：即使不起诉，公安机关仍可能保留案件材料（如询问笔录、证据等），但这些记录不属于“犯罪记录”，仅作为内部工作档案。根据《公安机关办理犯罪记录查询工作规定》，不起诉决定对应的人员可开具“无犯罪记录证明”，但查询时可能显示“曾受刑事立案”等备注信息。

3. 申请消除记录的途径

   • 无犯罪记录证明：向户籍地或居住地公安机关申请开具《无犯罪记录证明》，检察院不起诉决定通常不会影响证明的出具，但需注意证明中可能备注案件情况。
     
   • 封存或销毁记录：若案件涉及未成年人，根据《刑事诉讼法》第286条，符合条件的犯罪记录应予以封存，非经法定程序不得披露。成年人案件无自动封存或销毁规定，但若记录存在错误或违法，可向公安机关提出异议并申请更正。
     
   • 行政申诉：若记录因行政处罚产生，且处罚决定被撤销，可依据《行政处罚法》第75条要求公安机关删除相关记录。

4. 实务建议

   • 保留检察院不起诉决定书，作为后续申请处理记录的依据。
     
   • 若因记录影响就业、生活，可委托律师向公安机关出具法律意见书，说明记录的合法性、必要性问题，推动协商处理。
     
   • 定期查询个人犯罪记录，确保信息准确，避免因系统错误导致不必要的困扰。

总结：不起诉决定不直接消除公安机关记录，但可通过合法途径申请开具无犯罪记录证明或处理错误记录。具体操作需结合案件性质、记录类型及法律规定，建议根据实际情况进一步咨询。