集体法人打印公户流水是否合法，需分情况讨论：
合法情形：
- 法定代表人或授权人员：如果集体法人的法定代表人或经过合法授权的人员，因公司业务需要（如审计、税务申报、合同履行等），向银行申请打印公户流水，这是完全合法的。因为法定代表人作为公司的代表，有权处理公司的日常事务，包括银行账户的管理。授权人员则是在得到法定代表人或公司决策机构明确授权后，代为处理相关事务。
- 司法机关或行政机关要求：在涉及法律诉讼、行政调查等情况下，司法机关或行政机关有权要求集体法人提供公户流水作为证据或调查材料。此时，集体法人应配合提供，这也是合法的。
非法情形：
- 未经授权擅自打印：如果非法定代表人或未经授权的人员擅自打印集体法人的公户流水，这可能构成侵犯公司商业秘密或隐私的行为，是违法的。因为公户流水包含了公司的财务信息，属于公司的商业秘密或敏感信息，未经授权不得随意获取或泄露。
- 用于非法目的：即使是由法定代表人或授权人员打印的公户流水，如果被用于非法目的（如洗钱、诈骗等），也是违法的。因为这种行为不仅侵犯了公司的权益，还可能对社会造成危害。
法律建议：
- 确保合法授权：在打印公户流水前，应确保操作人员是法定代表人或经过合法授权的人员，并保留好相关的授权文件或记录。
- 明确用途：打印公户流水应明确用途，并确保用途合法合规。如果是用于公司业务需要，应做好相关的记录和存档工作；如果是应司法机关或行政机关要求，应要求对方出具正式的书面要求，并妥善保管。
- 加强信息保护：对于打印出的公户流水，应加强信息保护，防止泄露给无关人员或用于非法目的。可以采取加密存储、限制访问权限等措施来确保信息安全。
可能法律后果：
- 如果未经授权擅自打印公户流水或用于非法目的，可能会面临法律责任，包括民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。具体后果取决于行为的性质、情节以及造成的后果等因素。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。