公司与员工签订的合作协议，在符合法律规定的情况下，是具有法律认可的。以下从多个角度为你详细分析：

合作协议的法律性质

合作协议，本质上是一种合同，它规定了公司与员工之间的权利和义务。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，受法律保护。这意味着，只要合作协议的内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方意思表示真实，那么这份合作协议就是有效的，具有法律认可。

合作协议与劳动合同的区别

1. 法律性质：劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议，它受到《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的特别保护。而合作协议则更多地依据《中华人民共和国民法典》中的合同编来调整。
2. 内容侧重点：劳动合同通常包含工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬、社会保险等必备条款，强调劳动关系的稳定性和劳动者的权益保护。合作协议则可能更侧重于合作方式、利益分配、风险承担等商业合作方面的内容。
3. 法律后果：违反劳动合同可能导致劳动争议，需要经过劳动仲裁等程序解决。而违反合作协议则可能引发合同纠纷，需要通过诉讼或仲裁等方式解决。

合作协议的法律认可条件

1. 双方主体适格：即公司和员工都必须具备签订合同的法律资格。公司必须是依法注册成立的法人或其他组织，员工则必须是具有完全民事行为能力的自然人。
2. 意思表示真实：双方签订合作协议时，必须基于真实的意思表示，不存在欺诈、胁迫等情形。
3. 内容合法合规：合作协议的内容必须符合法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。例如，不能约定违法的内容，如非法交易、走私等。
4. 形式要件：虽然合作协议不一定需要采用书面形式，但为了证明双方的权利和义务，建议采用书面形式签订，并由双方签字或盖章确认。

合作协议可能面临的法律风险

1. 协议无效风险：如果合作协议的内容违反法律、行政法规的强制性规定，或者存在欺诈、胁迫等情形，那么该协议可能被认定为无效。
2. 履行不能风险：如果合作协议中的条款过于模糊或不确定，可能导致双方在履行过程中产生争议，甚至无法履行。
3. 违约风险：如果一方违反合作协议的约定，可能需要承担违约责任，包括赔偿损失、支付违约金等。

建议

1. 明确协议内容：在签订合作协议时，应明确双方的权利和义务，包括合作方式、利益分配、风险承担等条款，以避免未来产生争议。
2. 咨询专业律师：由于合作协议涉及复杂的法律问题，建议在签订前咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性。
3. 保留证据：在履行合作协议过程中，应保留好相关证据，如付款凭证、沟通记录等，以备不时之需。

如果你有具体的合作协议内容或相关法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律建议。